87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16363 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  100 
 
 
199 aa  415  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  37.06 
 
 
474 aa  104  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  32.82 
 
 
309 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  35.2 
 
 
294 aa  92.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  32.47 
 
 
293 aa  92.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  32.99 
 
 
282 aa  90.5  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  33.16 
 
 
277 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  31.8 
 
 
508 aa  88.2  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  34.26 
 
 
348 aa  86.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  31.61 
 
 
279 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  32.31 
 
 
575 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  31.94 
 
 
287 aa  85.5  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  30.89 
 
 
289 aa  84.7  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  33.8 
 
 
348 aa  84  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  33.5 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  30.93 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  32.99 
 
 
289 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  32.47 
 
 
288 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  29.74 
 
 
289 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  28.64 
 
 
269 aa  81.3  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  31.96 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  29.74 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  37.5 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  32.19 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34558  predicted protein  31.28 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.2 
 
 
277 aa  78.2  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  30.24 
 
 
257 aa  78.2  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  28.93 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  38.74 
 
 
427 aa  75.9  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  31.85 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  28.44 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  27.1 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  28.93 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  26.61 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  28.97 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  26.98 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  37.5 
 
 
584 aa  68.2  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  36.61 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  26.94 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  28.32 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  35.14 
 
 
376 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  25.39 
 
 
295 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  30.41 
 
 
216 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9147  predicted protein  33.33 
 
 
137 aa  62  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  24.89 
 
 
254 aa  61.6  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  33.04 
 
 
213 aa  61.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  28.87 
 
 
296 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  33.04 
 
 
213 aa  61.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  30.05 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  30.05 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.05 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  30.05 
 
 
232 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  27.27 
 
 
330 aa  60.1  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  28.51 
 
 
309 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  30.05 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  30.05 
 
 
216 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  24.87 
 
 
292 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  27.03 
 
 
317 aa  58.9  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1091  2OG-Fe(II) oxygenase  33.91 
 
 
416 aa  58.9  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  31.34 
 
 
216 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  29.02 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  29.53 
 
 
232 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1522  2OG-Fe(II) oxygenase  35.96 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  0.97292 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44137  predicted protein  53.33 
 
 
537 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128731  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34321  predicted protein  26.17 
 
 
302 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0494841  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49327  predicted protein  25.45 
 
 
360 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  40.28 
 
 
296 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02851  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_3G11980)  25.45 
 
 
300 aa  52  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  31.58 
 
 
327 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  29.09 
 
 
327 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  31.3 
 
 
327 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  31.3 
 
 
327 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  28.83 
 
 
324 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  29.29 
 
 
431 aa  48.9  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48732  predicted protein  29.94 
 
 
509 aa  48.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42426  predicted protein  35.21 
 
 
473 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24784  predicted protein  33.04 
 
 
347 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000305391  decreased coverage  0.000652774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2872  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  37.14 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0816  hypothetical protein  29.63 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0458692  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2806  2OG-Fe(II) oxygenase  38.03 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0614866  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  21.25 
 
 
606 aa  42.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2350  2OG-Fe(II) oxygenase  36.62 
 
 
231 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00524678  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2496  2OG-Fe(II) oxygenase  36.62 
 
 
231 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.193407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1848  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.62 
 
 
231 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000431215  hitchhiker  0.000791636 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2616  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.62 
 
 
231 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44920  predicted protein  36.62 
 
 
417 aa  41.6  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2332  2OG-Fe(II) oxygenase  38.03 
 
 
230 aa  41.6  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>