118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15806 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  100 
 
 		 506 aa  1050    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  44.15 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  43.71 
 
 		 503 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  43.46 
 
 		 520 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  31.98 
 
 		 578 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1346  zeta-carotene desaturase-like  32.99 
 
 		 543 aa  227  4e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  31.91 
 
 		 544 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11831  zeta-carotene desaturase-like protein  33.12 
 
 		 543 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.253964 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54051  pds-like2, phytoene desaturase-like protein  30.83 
 
 		 605 aa  205  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.250882  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10438  PDS-like 1, phytoene desaturase-like protein, phytoene dehydrogenase-like protein  29.44 
 
 		 545 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43187  predicted protein  29.24 
 
 		 557 aa  170  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140423  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  23.94 
 
 		 483 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.3 
 
 		 640 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  24.49 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  24.77 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  27.06 
 
 		 546 aa  77  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  23.4 
 
 		 453 aa  76.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  23.16 
 
 		 489 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  23.37 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  24.66 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  21.51 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  23.51 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  23.8 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  26.17 
 
 		 647 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  23.21 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.78 
 
 		 639 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  24.06 
 
 		 589 aa  71.2  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  22.71 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  24.68 
 
 		 811 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  23.01 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  24.25 
 
 		 645 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  22.38 
 
 		 599 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  25.82 
 
 		 647 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  25.82 
 
 		 647 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  23.33 
 
 		 481 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  23.82 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  23.75 
 
 		 624 aa  66.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  22.18 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  20.94 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  23.55 
 
 		 648 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  22.8 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  21.77 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.98 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23.14 
 
 		 465 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  20.48 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  23.64 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.94 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  22.54 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  22.54 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  22.92 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  23.14 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  22.11 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  20.94 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  24.57 
 
 		 639 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  21.46 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23.7 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  24.9 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  24.9 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  20.74 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.76 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  25.89 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  25.1 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  22.42 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  21.7 
 
 		 484 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.67 
 
 		 643 aa  57  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.55 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  22.34 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  20.88 
 
 		 461 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  22.61 
 
 		 642 aa  55.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  24.52 
 
 		 520 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  34.38 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  22.36 
 
 		 471 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  22.29 
 
 		 473 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.56 
 
 		 459 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  23.22 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  21.2 
 
 		 459 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  20 
 
 		 591 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  23.71 
 
 		 552 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  21.56 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  23.37 
 
 		 473 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  23.37 
 
 		 473 aa  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  23.37 
 
 		 473 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  23.96 
 
 		 482 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  21.37 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  35.05 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.82 
 
 		 474 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3433  putative dehydrogenase  38.55 
 
 		 433 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  22.77 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.59 
 
 		 644 aa  48.5  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  23.16 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0367  amine oxidase  40.79 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  21.75 
 
 		 475 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  21.75 
 
 		 475 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  23.55 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1091  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein, flavin amine oxidase  37.18 
 
 		 430 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4020  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2754  amine oxidase  37.18 
 
 		 430 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  22.96 
 
 		 551 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  62.5 
 
 		 487 aa  47  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  21.02 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>