More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15595 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_15595  predicted protein  100 
 
 
360 aa  751    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.46 
 
 
335 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 
355 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4693  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 
339 aa  411  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0351  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 
336 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 
337 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 
336 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.9 
 
 
337 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18651  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 
337 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8826 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_19560  predicted protein  55.21 
 
 
342 aa  381  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.387855  normal  0.373209 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4670  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.24 
 
 
335 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.406133  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10521  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 
337 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.167395  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 
337 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 
337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.852523  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
338 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
338 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0598  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
338 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06631  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 
347 aa  348  6e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3024  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
345 aa  308  8e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
327 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2728  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
338 aa  306  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1530  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
334 aa  302  6.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000759272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2200  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
365 aa  300  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2121  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
336 aa  300  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0128322 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002271  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
338 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0588  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
339 aa  298  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0600  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
332 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3877  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
334 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1252  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
348 aa  297  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0614  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
332 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.788097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0136  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
355 aa  295  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0748713  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
355 aa  295  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
327 aa  294  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00082  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
345 aa  294  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4054  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
334 aa  294  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.158316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0155  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
355 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0344  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
334 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
339 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.502429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0480  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
335 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.288652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 
328 aa  292  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
333 aa  292  7e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3690  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
332 aa  291  8e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3960  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
346 aa  291  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03236  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
334 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
334 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0231  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
346 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.610742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03188  hypothetical protein  44.23 
 
 
334 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0329  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
334 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.449952  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3580  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
334 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514705  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0255  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
332 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3721  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
346 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0742985  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3660  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
334 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0133889 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3853  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
334 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3886  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
332 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.410954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3761  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
334 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.602445  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4688  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
334 aa  290  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.79843  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
332 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4599  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
334 aa  289  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.763088  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3680  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
334 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.408983  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3787  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
334 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3753  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
334 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3678  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
334 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3849  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
334 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0658  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
337 aa  289  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
354 aa  289  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  hitchhiker  0.0000206811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0266  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
334 aa  289  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  45 
 
 
332 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3698  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
332 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1167  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0275  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
330 aa  286  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3608  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
335 aa  285  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0221  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
332 aa  285  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.023184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0370  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
353 aa  285  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0294  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
353 aa  285  9e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.496301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0338  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
353 aa  285  9e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0038  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.344371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0801  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
332 aa  281  9e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.154827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3797  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
334 aa  281  9e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0456101 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1239  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
344 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.244694 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0168  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
333 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0459  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
350 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.860654  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4871  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
337 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178107  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4075  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
332 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
338 aa  279  5e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0249  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
348 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0230616  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3995  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
332 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0754  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
328 aa  279  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4193  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
332 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4110  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 
329 aa  278  8e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2568  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
344 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4105  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
332 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
342 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1212  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
344 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>