268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_1550 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_1550  predicted protein  100 
 
 
381 aa  784    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.058598  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39911  predicted protein  35.07 
 
 
612 aa  216  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03820  Cell division control protein 16, putative  32.17 
 
 
840 aa  168  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52971  anaphase-promoting complex component  27.95 
 
 
698 aa  155  8e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08002  20S cyclosome subunit (Cut9/Cdc16), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02590)  28.9 
 
 
756 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 
878 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 
927 aa  73.9  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.53 
 
 
1056 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.57 
 
 
810 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.35 
 
 
818 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.47 
 
 
988 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.44 
 
 
758 aa  63.2  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.35 
 
 
1056 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.29 
 
 
784 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
405 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  21.51 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.14 
 
 
1022 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 
2240 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  20.74 
 
 
725 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 
301 aa  60.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.27 
 
 
602 aa  60.1  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.41 
 
 
784 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  21.48 
 
 
733 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  27.53 
 
 
538 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.43 
 
 
632 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 
566 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
465 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  26.47 
 
 
527 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
265 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.67 
 
 
1138 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
297 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
288 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
4079 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
297 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  22.9 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 
563 aa  56.6  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
1276 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  20.26 
 
 
356 aa  56.6  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
792 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  22.9 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
615 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  21.2 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.64 
 
 
610 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.5 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  19.05 
 
 
833 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
315 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  23.47 
 
 
340 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.25 
 
 
576 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 
366 aa  54.7  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
301 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
847 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.48 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
688 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  19.72 
 
 
610 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
711 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.8 
 
 
707 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  23.32 
 
 
620 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  23.29 
 
 
832 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
620 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
750 aa  52.8  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  21.37 
 
 
673 aa  53.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 
4489 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.22 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 
1049 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  19.27 
 
 
587 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06138  Protein bimA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P17885]  31.54 
 
 
642 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.112787  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03050  ubiquitin-protein ligase, putative  25.87 
 
 
773 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 
292 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
543 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  21.2 
 
 
534 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  21.52 
 
 
649 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0427  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.609361  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.63 
 
 
882 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 
562 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.75 
 
 
639 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  23.84 
 
 
864 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  23.74 
 
 
457 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 
409 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 
1371 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  19.39 
 
 
706 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 
573 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 
486 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  19.6 
 
 
681 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  27.64 
 
 
815 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  20.79 
 
 
706 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  20 
 
 
452 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  19.35 
 
 
409 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  20.1 
 
 
545 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 
718 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4194  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
178 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.27 
 
 
409 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.04 
 
 
471 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
274 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  20.64 
 
 
334 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
291 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>