25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15329 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_15329  predicted protein  100 
 
 
533 aa  1091    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45407  VIC family transporter: calcium ion channel  21.34 
 
 
938 aa  68.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.000000016856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0798  Ion transport protein  24.83 
 
 
274 aa  63.9  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.265179  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1880  Ion transport protein  22.54 
 
 
328 aa  60.1  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.893979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6234  ion transport protein  18.41 
 
 
278 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212299 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0150  Ion transport protein  20.14 
 
 
315 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5101  Ion transport protein  21.65 
 
 
304 aa  53.9  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.327555 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0322  Ion transport protein  21.26 
 
 
288 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297527  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0966  Ion transport protein  19.71 
 
 
281 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32140  VIC family transporter: calcium ion channel  20.13 
 
 
1701 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  unclonable  0.00000826212  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28283  VIC family transporter: calcium ion channel  22.34 
 
 
1742 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.501794  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03691  Kef-type K+ transport system, NAD-binding component  20.68 
 
 
284 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.270624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0421  Ion transport protein  20.27 
 
 
282 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_54164  bacterial type voltage activated sodium channel  22.39 
 
 
415 aa  50.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0383  hypothetical protein  23.84 
 
 
312 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3493  voltage-gated sodium channel  21.88 
 
 
262 aa  48.9  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.840711  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51591  calcium binding protein  31.76 
 
 
132 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0915  Ion transport protein  22.97 
 
 
278 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0582642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2848  Ion transport protein  22.73 
 
 
261 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1696  Ion transport protein  21.48 
 
 
280 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3143  Ion transport protein  28.75 
 
 
273 aa  45.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2895  Ion transport protein  21.68 
 
 
261 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.248664  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7925  VIC family transporter: sodium ion channel  21.68 
 
 
256 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2187  Ion transport protein  21.5 
 
 
300 aa  44.3  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0546  Ion transport protein  18.81 
 
 
276 aa  43.9  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>