More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15324 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_15324  predicted protein  100 
 
 
378 aa  753    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  38.64 
 
 
494 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  34.66 
 
 
490 aa  224  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  33.75 
 
 
486 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  33.75 
 
 
486 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  36.34 
 
 
467 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  36.34 
 
 
467 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  34.34 
 
 
483 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  36.34 
 
 
467 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  36.34 
 
 
467 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  36.34 
 
 
467 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  36.05 
 
 
491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  36.34 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  36.6 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  36.34 
 
 
467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  34.34 
 
 
496 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  35.07 
 
 
496 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  35.07 
 
 
496 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  36.08 
 
 
467 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  34.7 
 
 
512 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  36.08 
 
 
467 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  37.65 
 
 
486 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  34.47 
 
 
495 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  35.34 
 
 
513 aa  206  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  35.75 
 
 
488 aa  204  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  39.22 
 
 
471 aa  203  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  35.82 
 
 
476 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  34.33 
 
 
496 aa  202  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  33.76 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  33.76 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  33.76 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  33.76 
 
 
471 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  33.25 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  33.76 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  33.76 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  35.57 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  33.76 
 
 
471 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  34.47 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  33.5 
 
 
489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  34.02 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  35.64 
 
 
438 aa  199  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  33.76 
 
 
471 aa  199  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  34.06 
 
 
502 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  34.03 
 
 
471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  37.34 
 
 
464 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  35.77 
 
 
488 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  33 
 
 
549 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  35.23 
 
 
476 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  31.84 
 
 
489 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  36.68 
 
 
482 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  35.82 
 
 
476 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  33.76 
 
 
471 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  33.76 
 
 
471 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  33.76 
 
 
471 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  36.36 
 
 
468 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  34.78 
 
 
476 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  35.36 
 
 
518 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  33.01 
 
 
515 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  32.52 
 
 
500 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  35.81 
 
 
474 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  38.02 
 
 
481 aa  193  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  33.51 
 
 
471 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  35.56 
 
 
503 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  34.24 
 
 
485 aa  192  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  35.04 
 
 
504 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  32.68 
 
 
491 aa  190  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  30.79 
 
 
549 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  32.32 
 
 
471 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  34.95 
 
 
497 aa  189  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  31.57 
 
 
520 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  32.32 
 
 
471 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  32.32 
 
 
471 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  33.49 
 
 
503 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  32.57 
 
 
471 aa  189  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  34.26 
 
 
495 aa  189  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  33.74 
 
 
495 aa  189  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  34.11 
 
 
471 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  33.59 
 
 
471 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  33.25 
 
 
495 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  32.44 
 
 
516 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  34.11 
 
 
471 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  34.31 
 
 
503 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  31.03 
 
 
456 aa  189  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  34.11 
 
 
471 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  32.73 
 
 
471 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  34.11 
 
 
471 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4360  amino acid permease-associated region  33.49 
 
 
686 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120164  normal  0.0594951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4398  amino acid permease-associated region  35.77 
 
 
488 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  35.39 
 
 
486 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  35.21 
 
 
496 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  35.29 
 
 
493 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  33.91 
 
 
480 aa  186  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  35.66 
 
 
466 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  34.45 
 
 
491 aa  185  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  33.16 
 
 
462 aa  186  9e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  34.94 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  31.38 
 
 
542 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  33.5 
 
 
471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  34.72 
 
 
465 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  32.61 
 
 
494 aa  184  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>