49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15310 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_15310  predicted protein  100 
 
 
190 aa  396  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804518  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04350  conserved hypothetical protein  35.47 
 
 
576 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5433  predicted protein  34.27 
 
 
316 aa  108  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3954  predicted protein  32.68 
 
 
344 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87051  predicted protein  30.96 
 
 
714 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.168813  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4512  predicted protein  30.81 
 
 
312 aa  98.2  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873462  normal  0.145734 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42729  predicted protein  29.57 
 
 
1003 aa  96.7  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01600  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 
728 aa  93.6  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03711  ubiquitin C-terminal hydrolase Ubp8, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12710)  32.88 
 
 
484 aa  93.6  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.954307  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39658  predicted protein  33.16 
 
 
311 aa  93.2  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334345  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03587  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase (EC 3.1.2.15) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96V54]  33.93 
 
 
766 aa  90.5  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_3692  predicted protein  33.53 
 
 
347 aa  90.1  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02072  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04720)  30.53 
 
 
1022 aa  88.2  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.701074 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07360  ubiquitin-specific protease, putative  31.96 
 
 
1312 aa  83.2  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6409  predicted protein  28.77 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12752  predicted protein  34.29 
 
 
348 aa  81.6  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02890  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, putative  27.41 
 
 
1113 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59469  predicted protein  25.69 
 
 
701 aa  79.7  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185317  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32361  predicted protein  28.12 
 
 
565 aa  79.3  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62413  predicted protein  29.47 
 
 
848 aa  77.8  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.776839  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  27.09 
 
 
1209 aa  75.9  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05186  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  32.26 
 
 
840 aa  74.3  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000787837  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36349  predicted protein  28.89 
 
 
1127 aa  72  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0304624  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_90001  Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase  27 
 
 
1322 aa  71.6  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46434  predicted protein  25.09 
 
 
631 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03800  ubiquitin specific protease, putative  28.27 
 
 
599 aa  69.7  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00100  ubiquitin-specific protease, putative  31.71 
 
 
1099 aa  70.1  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0377728  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06354  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14130)  36.15 
 
 
1418 aa  65.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.387584  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39993  predicted protein  28.06 
 
 
688 aa  64.7  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000426118  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44745  predicted protein  28.57 
 
 
1075 aa  62.8  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.362492  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_62908  predicted protein  23.58 
 
 
879 aa  62.4  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2936  predicted protein  29.07 
 
 
344 aa  61.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69820  predicted protein  32.89 
 
 
1340 aa  60.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47704  predicted protein  33.87 
 
 
1183 aa  58.9  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59800  predicted protein  24.14 
 
 
489 aa  57  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46080  predicted protein  26.7 
 
 
1370 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46292  predicted protein  27.36 
 
 
772 aa  55.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29340  predicted protein  22.69 
 
 
499 aa  54.7  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.210564  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03680  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, putative  34.23 
 
 
1490 aa  54.7  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.920906  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17041  predicted protein  23.83 
 
 
379 aa  52  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.852844  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21982  predicted protein  30.6 
 
 
641 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40154  predicted protein  30.57 
 
 
319 aa  49.7  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13360  predicted protein  55.56 
 
 
461 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000134973 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_974  predicted protein  23.81 
 
 
603 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000875731  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11102  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02380)  40.43 
 
 
572 aa  45.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235915  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07422  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G06330)  45.65 
 
 
697 aa  41.6  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.942281  hitchhiker  0.000000000000044106 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37903  deubiquitinating enzyme  41.86 
 
 
481 aa  41.6  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.816359  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31584  predicted protein  23.83 
 
 
618 aa  41.2  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000066135  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1805  hypothetical protein  39.47 
 
 
339 aa  41.2  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>