More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15297 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_15297  predicted protein  100 
 
 
146 aa  296  8e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  39.33 
 
 
363 aa  94.7  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  39.33 
 
 
363 aa  94.7  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
324 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 
303 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 
307 aa  90.9  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 
304 aa  90.9  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 
303 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 
316 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
320 aa  86.3  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 
300 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 
300 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  36.3 
 
 
303 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 
300 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  36.99 
 
 
302 aa  84.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
300 aa  84  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 
302 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  32.19 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  36.3 
 
 
304 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
306 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 
315 aa  80.9  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  31.51 
 
 
309 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
287 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
301 aa  80.1  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  30.82 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  32.43 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  29.45 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
327 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  34.25 
 
 
301 aa  78.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
303 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  36.05 
 
 
317 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  34.93 
 
 
311 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 
320 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  40.41 
 
 
300 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  36.3 
 
 
299 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  28.77 
 
 
309 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 
311 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
312 aa  77  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
304 aa  77.4  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.88 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.88 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  32.88 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  32.88 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.12 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
324 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.56 
 
 
320 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 
324 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 
305 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
310 aa  73.6  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
328 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
237 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  36.42 
 
 
324 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 
308 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
326 aa  71.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  35.62 
 
 
305 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 
312 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11116  predicted protein  34.25 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.778599  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
307 aa  71.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
312 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  33.56 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44630  predicted protein  36.36 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
333 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 
312 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
331 aa  67.8  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 
314 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4187  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 
312 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 
271 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
292 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
328 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
310 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05653  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02580)  36.3 
 
 
360 aa  67  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.67248 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  37.5 
 
 
306 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  33.56 
 
 
321 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
281 aa  67  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
313 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
315 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  34.25 
 
 
321 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
331 aa  67  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4041  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138801  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.82 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>