More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15212 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_15212  predicted protein  100 
 
 
475 aa  979    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  32 
 
 
512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  32.31 
 
 
589 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  30.08 
 
 
583 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  29.82 
 
 
580 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  29.82 
 
 
580 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  31.57 
 
 
510 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  31.25 
 
 
579 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 
578 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 
578 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  31.05 
 
 
578 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 
578 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  31.05 
 
 
578 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 
578 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  31.05 
 
 
578 aa  227  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  30.86 
 
 
578 aa  227  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  31.05 
 
 
578 aa  227  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  30.47 
 
 
585 aa  226  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  30.1 
 
 
576 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  31.6 
 
 
583 aa  223  6e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  29.49 
 
 
580 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  29.27 
 
 
575 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  31.6 
 
 
929 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  29.65 
 
 
593 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  28.71 
 
 
582 aa  216  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  30.47 
 
 
578 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  30.47 
 
 
578 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  30.47 
 
 
578 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  30.47 
 
 
578 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  30.47 
 
 
578 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  29.24 
 
 
576 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  33.12 
 
 
901 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  29.61 
 
 
578 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  33.12 
 
 
901 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  30.56 
 
 
579 aa  209  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  30.46 
 
 
906 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  31.52 
 
 
932 aa  209  9e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  31.87 
 
 
943 aa  208  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  32.29 
 
 
933 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.46 
 
 
906 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  29.06 
 
 
582 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  28.29 
 
 
580 aa  204  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  30.25 
 
 
906 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  27.31 
 
 
541 aa  204  4e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  29.71 
 
 
585 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  30.47 
 
 
578 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  31.38 
 
 
930 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  28.76 
 
 
599 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  29.76 
 
 
651 aa  200  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  30.11 
 
 
909 aa  200  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  29.39 
 
 
551 aa  199  9e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  31.43 
 
 
901 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  29.77 
 
 
593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  30.04 
 
 
904 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  30.51 
 
 
914 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  28.4 
 
 
926 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  29.55 
 
 
590 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  30.29 
 
 
915 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  29.75 
 
 
590 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  29.26 
 
 
594 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  30.9 
 
 
920 aa  196  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  29.88 
 
 
912 aa  196  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  28.19 
 
 
581 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  30.27 
 
 
917 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  30.27 
 
 
925 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  29.48 
 
 
587 aa  193  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  29.61 
 
 
924 aa  193  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  30.23 
 
 
930 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  30.39 
 
 
911 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  30.39 
 
 
911 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  30.39 
 
 
911 aa  192  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  30.39 
 
 
911 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  29.94 
 
 
912 aa  192  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  30.39 
 
 
911 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  30.39 
 
 
911 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  30.95 
 
 
921 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  28.43 
 
 
922 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  30.39 
 
 
911 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  29.96 
 
 
913 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  30.39 
 
 
911 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  30.21 
 
 
916 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  29.65 
 
 
927 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  30.18 
 
 
911 aa  191  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  29.58 
 
 
913 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  28.07 
 
 
588 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  29.75 
 
 
913 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  29.75 
 
 
913 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  29.23 
 
 
921 aa  189  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  29.65 
 
 
927 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  30.46 
 
 
918 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  30.29 
 
 
994 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  30.06 
 
 
911 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  29.5 
 
 
906 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  29.44 
 
 
901 aa  186  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  29.68 
 
 
911 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  28.9 
 
 
916 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  30.51 
 
 
922 aa  183  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  30.26 
 
 
1017 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  30.32 
 
 
919 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  30.19 
 
 
942 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>