More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15211 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_15211  predicted protein  100 
 
 
91 aa  187  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12737  predicted protein  68.25 
 
 
71 aa  94.4  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32237  predicted protein  58.44 
 
 
106 aa  88.6  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.18416 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_9256  predicted protein  57.14 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3620  cold-shock DNA-binding protein  53.97 
 
 
68 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1952  cold-shock DNA-binding protein family protein  53.97 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3621  cold-shock DNA-binding protein  53.97 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4329  hypothetical protein  54.84 
 
 
68 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.208733 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3140  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.44 
 
 
68 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.577228  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0603  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.12 
 
 
68 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4290  hypothetical protein  53.97 
 
 
68 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0166  major cold shock protein  55.93 
 
 
70 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  62.07 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4258  hypothetical protein  52.38 
 
 
68 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321323  normal  0.982609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2024  cold-shock DNA-binding protein family protein  52.38 
 
 
68 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.38 
 
 
68 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.976411  normal  0.373537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3970  major cold shock protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03406  major cold shock protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0156  cold-shock DNA-binding domain protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2681  cold-shock DNA-binding domain protein  48.39 
 
 
68 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.741556  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  60.34 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3845  major cold shock protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.644384  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0160  major cold shock protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  57.14 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  53.97 
 
 
67 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2065  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.44 
 
 
68 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142025 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4033  major cold shock protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3864  major cold shock protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03357  hypothetical protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  57.14 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3973  major cold shock protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3877  major cold shock protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.76351  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4932  major cold shock protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3929  major cold shock protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3757  major cold shock protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4052  major cold shock protein  54.24 
 
 
70 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00992  DNA-binding transcriptional regulator  55.56 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2653  cold-shock DNA-binding domain protein  55.56 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000496106  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55 
 
 
70 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2326  cold shock protein CspG  55.56 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000227415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00999  hypothetical protein  55.56 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1099  cold shock protein CspG  55.56 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1225  cold shock protein CspG  55.56 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000203795  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  60.34 
 
 
69 aa  72.4  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  57.14 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  55 
 
 
70 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55 
 
 
70 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2135  cold shock protein CspG  55.56 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2607  cold shock protein CspG  55.56 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1105  cold shock protein CspG  55.56 
 
 
70 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000233553  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0591  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.44 
 
 
68 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1650  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.17 
 
 
71 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.44 
 
 
68 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0495  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.44 
 
 
68 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5001  cold shock protein  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.56924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2474  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00166025  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  58.62 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2122  cold-shock DNA-binding domain protein  54.55 
 
 
70 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  57.63 
 
 
67 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  55.36 
 
 
69 aa  71.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2213  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000972653  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  58.62 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2822  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000720852  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.93 
 
 
67 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1920  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000217103  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  58.62 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01793  stress protein, member of the CspA-family  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000145825  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1820  cold-shock DNA-binding domain protein  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000376643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2554  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000000810099  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1913  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2038  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000133144  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  57.89 
 
 
70 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1365  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000234098  normal  0.0150165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1977  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000786929  normal  0.190727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1981  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000173649  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01781  hypothetical protein  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000220518  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1949  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.67 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589262  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2051  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2089  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.57783e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1478  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000112944  normal  0.636634 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1294  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000632959  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2393  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0922  cold-shock DNA-binding domain protein  53.33 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11423  normal  0.220498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0809  cold-shock DNA-binding domain protein  53.33 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2027  cold shock-like protein CspC  56.25 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1840  cold-shock DNA-binding domain protein  57.89 
 
 
70 aa  70.9  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>