More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15186 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_09419  alanyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03880)  45.57 
 
 		 961 aa  801    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000381337 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02520  alanine-tRNA ligase, putative  44.14 
 
 		 1012 aa  764    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37270  predicted protein  49.05 
 
 		 967 aa  787    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0476971  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47999  predicted protein  47.22 
 
 		 955 aa  834    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15186  predicted protein  100 
 
 		 959 aa  1979    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88206  Alanyl-tRNA synthetase, cytoplasmic (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  49.33 
 
 		 954 aa  803    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.898121 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0330  alanyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 886 aa  611  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43097  normal  0.0181617 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 876 aa  586  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1446  alanyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 877 aa  586  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.714674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0243  alanyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 888 aa  588  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2668  alanyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 888 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2535  alanyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 900 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 890 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0206  alanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 888 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 892 aa  572  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1560  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 953 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0446  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 871 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5667  alanyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 886 aa  569  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0578  alanyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 879 aa  566  1e-160  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1383  alanyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 942 aa  563  1.0000000000000001e-159  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0477098  hitchhiker  0.00263773 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0369  alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 886 aa  561  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.134799  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04755  alanyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 870 aa  562  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.604916  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 860 aa  557  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2378  alanyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 890 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 875 aa  555  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 876 aa  549  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 876 aa  549  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 876 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 876 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1952  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 887 aa  551  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.491503  normal  0.143708 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 876 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 865 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 876 aa  548  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 876 aa  548  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 876 aa  549  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 876 aa  548  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 876 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  37.13 
 
 		 876 aa  548  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 876 aa  549  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0302  alanyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 885 aa  546  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.125416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 876 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 		 874 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 876 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 874 aa  544  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0990  alanyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 865 aa  545  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 865 aa  544  1e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 874 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 874 aa  545  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 860 aa  544  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 884 aa  545  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 874 aa  542  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 887 aa  541  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 891 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 876 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 875 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 903 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 874 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1894  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 879 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 860 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 860 aa  536  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 886 aa  538  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 860 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 865 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 891 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 897 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 875 aa  538  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 876 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 897 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 874 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 876 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 865 aa  534  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 874 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 874 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 897 aa  535  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 875 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 874 aa  533  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 875 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 874 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 874 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 876 aa  533  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3523  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 895 aa  535  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0021732 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 875 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0127  alanyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 877 aa  533  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0445567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 890 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 875 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 874 aa  533  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  37.49 
 
 		 874 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 872 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 874 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 874 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 874 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 888 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 874 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 874 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 874 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 874 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 874 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3124  alanyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 874 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.600607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1478  alanyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 882 aa  530  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.734898  normal  0.362746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 878 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>