More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14998 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_14998  predicted protein  100 
 
 
582 aa  1202    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  40.81 
 
 
732 aa  402  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  41.02 
 
 
752 aa  392  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  38.64 
 
 
751 aa  386  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  39.2 
 
 
533 aa  358  9.999999999999999e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 
638 aa  342  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  37.22 
 
 
527 aa  340  2.9999999999999998e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  38.66 
 
 
624 aa  339  7e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  38.64 
 
 
639 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  38.64 
 
 
659 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  36.82 
 
 
629 aa  333  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  36.94 
 
 
557 aa  332  1e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.75 
 
 
635 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  37.15 
 
 
638 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.57 
 
 
635 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.57 
 
 
635 aa  329  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  38.16 
 
 
615 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 
635 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  38.16 
 
 
615 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  38.16 
 
 
642 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  38.01 
 
 
615 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.38 
 
 
635 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  38.64 
 
 
643 aa  327  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  37.34 
 
 
656 aa  327  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1075  predicted protein  37.96 
 
 
518 aa  326  6e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.45 
 
 
635 aa  326  7e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  35.36 
 
 
631 aa  326  8.000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.26 
 
 
637 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  36.07 
 
 
627 aa  326  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.15 
 
 
637 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  36.15 
 
 
637 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  36.15 
 
 
637 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.15 
 
 
637 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.15 
 
 
637 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.15 
 
 
637 aa  325  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.15 
 
 
637 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.15 
 
 
637 aa  325  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  36.07 
 
 
627 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
640 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
640 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
640 aa  323  4e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89200  predicted protein  34.43 
 
 
685 aa  323  4e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.564175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  37.64 
 
 
637 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  37.64 
 
 
637 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  37.15 
 
 
636 aa  323  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  37.15 
 
 
637 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  37.15 
 
 
637 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  37.15 
 
 
637 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.26 
 
 
635 aa  323  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  37.64 
 
 
637 aa  323  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  37.64 
 
 
637 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  36.84 
 
 
633 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  36.96 
 
 
637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.18 
 
 
637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  36.08 
 
 
521 aa  322  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.02 
 
 
634 aa  320  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 
637 aa  320  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  36.77 
 
 
636 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  37.24 
 
 
618 aa  317  5e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  36.3 
 
 
654 aa  317  5e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  35.83 
 
 
657 aa  316  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  36.4 
 
 
673 aa  316  7e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 
651 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  36.59 
 
 
633 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  38.26 
 
 
650 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  36.21 
 
 
636 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  38.59 
 
 
636 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
635 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.21 
 
 
639 aa  314  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  36.35 
 
 
636 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  36.21 
 
 
650 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.38 
 
 
639 aa  313  4.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2715  ABC transporter related  36.6 
 
 
650 aa  313  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  36.7 
 
 
645 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  34.89 
 
 
636 aa  312  9e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  36.6 
 
 
615 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  34.07 
 
 
637 aa  311  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  37.52 
 
 
635 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  36.33 
 
 
636 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0238  ABC transporter related  38.66 
 
 
625 aa  310  6.999999999999999e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.773221  normal  0.692019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  37.17 
 
 
636 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  35.78 
 
 
623 aa  308  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  36.24 
 
 
609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  34.2 
 
 
627 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  37.8 
 
 
638 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  34.64 
 
 
625 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0048  ABC transporter related  33.64 
 
 
664 aa  307  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  38.4 
 
 
633 aa  306  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  37.11 
 
 
636 aa  306  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03980  ABC transporter ATP-binding protein  37.82 
 
 
650 aa  306  8.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1302  ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 
639 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2480  ABC transporter-related protein  36.1 
 
 
676 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404041  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  35.5 
 
 
627 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.62 
 
 
638 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0037  ABC transporter ATPase  33.15 
 
 
672 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.489009  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  36.87 
 
 
621 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  36.69 
 
 
621 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3608  ABC transporter related  35.85 
 
 
687 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100909  normal  0.0123712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  36.31 
 
 
620 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  35.53 
 
 
645 aa  303  6.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>