127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14762 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_14762  isocitrate dehydrogenase  100 
 
 		 357 aa  746    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29641  predicted protein  64.99 
 
 		 409 aa  497  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47417  predicted protein  66.09 
 
 		 397 aa  488  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4210  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  36.36 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2528  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  35.88 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000000300783  normal  0.0692405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2568  isocitrate dehydrogenase  34.54 
 
 		 406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05050  isocitrate dehydrogenase  34.86 
 
 		 407 aa  182  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0685  isocitrate dehydrogenase  34.75 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0665  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  35.8 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0826839  normal  0.106014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3960  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  33.89 
 
 		 405 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.797377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7976  isocitrate dehydrogenase  35.31 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1222  isocitrate dehydrogenase NADP-dependent  33.61 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0593452  normal  0.0592242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13371  isocitrate dehydrogenase  35.13 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.510485 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0285  isocitrate dehydrogenase  34.82 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.432651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1254  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  34.56 
 
 		 404 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0565  isocitrate dehydrogenase  33.62 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3007  isocitrate dehydrogenase  34.46 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.375346  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6478  isocitrate dehydrogenase  35.14 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1281  isocitrate dehydrogenase  35.23 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000588967  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3988  isocitrate dehydrogenase  35.31 
 
 		 404 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1161  isocitrate dehydrogenase  33.99 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1913  isocitrate dehydrogenase  34.75 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06080  isocitrate dehydrogenase  34.46 
 
 		 397 aa  170  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.54235 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04090  isocitrate dehydrogenase (NADP+), putative  33.9 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00968554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1011  isocitrate dehydrogenase  34.56 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1459  isocitrate dehydrogenase  33.9 
 
 		 400 aa  169  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.362836  normal  0.369512 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3039  isocitrate dehydrogenase  33.9 
 
 		 404 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5427  isocitrate dehydrogenase  32.49 
 
 		 405 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444249  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2164  isocitrate dehydrogenase  34.08 
 
 		 403 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0263756  normal  0.0589058 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0388  isocitrate dehydrogenase  34.75 
 
 		 407 aa  169  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1199  isocitrate dehydrogenase  33.71 
 
 		 404 aa  169  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1294  isocitrate dehydrogenase  32.96 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.471014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0911  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  33.33 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4569  isocitrate dehydrogenase  33.62 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0119875  normal  0.19569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1737  isocitrate dehydrogenase  32.96 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0743  isocitrate dehydrogenase  32.78 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.262028  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2099  isocitrate dehydrogenase  33.62 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.369839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2367  isocitrate dehydrogenase  33.33 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3530  isocitrate dehydrogenase  34.84 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00918215 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0446  isocitrate dehydrogenase  33.62 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1559  isocitrate dehydrogenase  33.62 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0210  isocitrate dehydrogenase  33.62 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.718507  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1523  isocitrate dehydrogenase  33.05 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.030562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4173  isocitrate dehydrogenase  33.52 
 
 		 404 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374158  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3732  isocitrate dehydrogenase  32.68 
 
 		 408 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0398  isocitrate dehydrogenase  34.57 
 
 		 406 aa  166  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.287914  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0327  isocitrate dehydrogenase  33.06 
 
 		 403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1576  isocitrate dehydrogenase  33.33 
 
 		 407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1953  isocitrate dehydrogenase  33.8 
 
 		 403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123809  normal  0.403096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3793  isocitrate dehydrogenase  33.52 
 
 		 404 aa  166  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0923125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1133  isocitrate dehydrogenase  32.87 
 
 		 405 aa  165  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.994412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4362  isocitrate dehydrogenase  33.15 
 
 		 407 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4413  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  33.24 
 
 		 404 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6592  isocitrate dehydrogenase  33.62 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.685911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4814  isocitrate dehydrogenase  33.71 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0820117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2631  isocitrate dehydrogenase  33.71 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.205618 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02999  Mitochondrial NADP-dependent isocitrate dehydrogenase (EC 1.1.1.42) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UN7]  33.15 
 
 		 493 aa  162  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.626077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3527  isocitrate dehydrogenase  33.24 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.43028  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2545  isocitrate dehydrogenase  32.59 
 
 		 405 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1623  isocitrate dehydrogenase  32.96 
 
 		 405 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1992  isocitrate dehydrogenase  33.24 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1668  isocitrate dehydrogenase  32.49 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1519  isocitrate dehydrogenase  32.96 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.997525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5765  isocitrate dehydrogenase  33.99 
 
 		 404 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1602  isocitrate dehydrogenase  32.21 
 
 		 399 aa  159  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72104  Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial precursor (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (NADP(+)-specific ICDH) (IDP) (CtIDP1)  33.14 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0593553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1228  isocitrate dehydrogenase  33.52 
 
 		 410 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1267  isocitrate dehydrogenase  31.55 
 
 		 404 aa  156  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2576  isocitrate dehydrogenase  32.01 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.050087  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1117  isocitrate dehydrogenase  31.92 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3254  isocitrate dehydrogenase  32.58 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2580  isocitrate dehydrogenase  32.58 
 
 		 407 aa  152  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0101084  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1964  isocitrate dehydrogenase  31.36 
 
 		 404 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.431704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2878  isocitrate dehydrogenase  31.36 
 
 		 400 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.367797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0356  isocitrate dehydrogenase  32.49 
 
 		 405 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2961  isocitrate dehydrogenase  31.94 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0688602  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0457  isocitrate dehydrogenase  32.04 
 
 		 406 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0527606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4767  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  33.33 
 
 		 405 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3730  isocitrate dehydrogenase  33.05 
 
 		 403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377053  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1282  isocitrate dehydrogenase  32.3 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393913  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2372  isocitrate dehydrogenase  32.1 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.661778 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43870  Isocitrate dehydrogenase [NADP] peroxisomal (Oxalosuccinate decarboxylase) (IDH) (PS-NADP-IDH) (CtIDP2)  31.11 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3338  isocitrate dehydrogenase  34.46 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3141  isocitrate dehydrogenase  34.46 
 
 		 404 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120498  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3463  isocitrate dehydrogenase  34.46 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0212  isocitrate dehydrogenase  30.11 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0938573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0575  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  27.1 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.879672  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3677  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  24.61 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0450  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  25.08 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0133  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  24.38 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2072  isocitrate dehydrogenase (NADP)  33.04 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.311168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3538  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  25.79 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3381  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.19 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461666  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  24.28 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4224  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.48 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3287  3-isopropylmalate dehydrogenase  29.52 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.339501  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.48 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.143543  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6646  3-isopropylmalate dehydrogenase  25.4 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20934  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.39 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  28.57 
 
 		 357 aa  47  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>