More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14715 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_14715  predicted protein  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  39.43 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4011  ribosomal protein L10  38.95 
 
 
175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0274883  hitchhiker  0.0000000471613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 
178 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02201  50S ribosomal protein L10  37.13 
 
 
175 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.825352  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02201  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 
175 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.756015  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02221  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 
175 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0204  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 
175 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02311  50S ribosomal protein L10  35.33 
 
 
175 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 
181 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0263  50S ribosomal protein L10  38.27 
 
 
190 aa  100  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273866  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 
175 aa  98.6  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1569  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02781  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 
175 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.210657  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  36.75 
 
 
175 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2154  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.44563  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36113  Plastid ribosomal protein L10, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  33.71 
 
 
212 aa  89.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  36.25 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 
175 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  34.18 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  34.15 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  32.92 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  36.48 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  34.38 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  37.78 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  37.78 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  32.7 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  33.13 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  32.3 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  32.3 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  29.82 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  29.82 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  32.5 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  34.92 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  31.68 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  32.1 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  31.9 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  34.16 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  30.86 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  34.56 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  30.59 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  31.9 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  30.43 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  31.71 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  32.89 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  31.9 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  33.73 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  30.91 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  31.29 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  30 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  30 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  30 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  30 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  30 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  27.81 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  30 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  30 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  30 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  32.21 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  32.21 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  34.57 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  28.16 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  29.75 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  30.12 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  28.29 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2198  50S ribosomal protein L10  34.97 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000455583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  32.17 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  31.25 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  28.24 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04532  50S ribosomal protein L10  28.32 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.165522  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2108  50S ribosomal protein L10  34.97 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000349119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  30.34 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  37.31 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  28.65 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  32.08 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  30.63 
 
 
172 aa  64.3  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  26.29 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  29.75 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  26.29 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  30.63 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  36.03 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  29.94 
 
 
172 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  28.74 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  27.85 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  28.83 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  34.06 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  34.62 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  34.97 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  27.22 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  26.16 
 
 
175 aa  61.2  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  29.19 
 
 
172 aa  61.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>