83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14571 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  46.46 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  43.72 
 
 		 303 aa  148  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  44.39 
 
 		 267 aa  137  8.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  42.62 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  32.84 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  31.34 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  31.38 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  34.2 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  32.16 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  30.69 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  32.29 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  31.79 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  32.61 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  32.46 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  29.74 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  32.04 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  29.26 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  28.42 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  31.91 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  29.29 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  29.29 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  29.59 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  29.17 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  32.64 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  31.58 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  27.08 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  30.37 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  27.98 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  27.6 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.79 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  28.06 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  25.13 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.61 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  29.74 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.06 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.61 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  28.95 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  29.19 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.27 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  24.74 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  28.95 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.43 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  27.78 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  30.39 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  27.53 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  27.18 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  24.16 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  28 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  29.02 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  27.81 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  26.67 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  23.28 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  26.74 
 
 		 297 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  29.83 
 
 		 301 aa  52  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  30.3 
 
 		 249 aa  52  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  24.87 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  27.17 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  26.15 
 
 		 259 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  29.09 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.05 
 
 		 249 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.32 
 
 		 243 aa  48.9  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  29.56 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  24.64 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  24.37 
 
 		 271 aa  46.2  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  26.97 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  24.1 
 
 		 259 aa  45.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.27 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  23.65 
 
 		 248 aa  45.4  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  29.21 
 
 		 247 aa  45.1  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  26.4 
 
 		 245 aa  45.1  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  28.09 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  22.28 
 
 		 250 aa  43.9  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  25.25 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  22.75 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  23.74 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  27.81 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.57 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  28.41 
 
 		 280 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  26.32 
 
 		 268 aa  42.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  26.83 
 
 		 235 aa  42  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  27.68 
 
 		 271 aa  41.2  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>