17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14536 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_14536  predicted protein  100 
 
 
150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00710  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  44.94 
 
 
220 aa  151  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28054  predicted protein  47.14 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.066003 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05519  AP-3 adaptor complex subunit sigma, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13020)  40.76 
 
 
185 aa  134  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.198267 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55999  predicted protein  50 
 
 
159 aa  123  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_54935  predicted protein  38.16 
 
 
152 aa  103  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26214  predicted protein  39.55 
 
 
155 aa  100  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15237  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04240  conserved hypothetical protein  34 
 
 
164 aa  100  9e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50523  predicted protein  33.11 
 
 
153 aa  94.7  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.441428  normal  0.351185 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07682  AP-1 adaptor complex subunit sigma, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01570)  33.1 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.651309  normal  0.358442 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54718  predicted protein  32.24 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26258  predicted protein  36.5 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.709266  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01420  vesicle-mediated transport-related protein, putative  38.73 
 
 
215 aa  87.8  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40610  predicted protein  35.1 
 
 
143 aa  87.4  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.119442  normal  0.0353096 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00722  AP-2 complex subunit sigma (Sigma2-adaptin)(Adaptin small chain)(Clathrin assembly protein 2 small chain) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFF8]  36.55 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.269069  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86644  predicted protein  33.8 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339516  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36149  predicted protein  36.23 
 
 
202 aa  82  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>