108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14518 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  100 
 
 
279 aa  558  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  41.6 
 
 
355 aa  167  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  39.86 
 
 
384 aa  159  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  36.76 
 
 
374 aa  142  8e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  32.09 
 
 
1266 aa  92.4  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  28.57 
 
 
772 aa  85.5  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.37 
 
 
1351 aa  79  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  27.41 
 
 
995 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  29.5 
 
 
1070 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  29.5 
 
 
1070 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  29.5 
 
 
1112 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.36 
 
 
1107 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  27.24 
 
 
1052 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  29.88 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.28 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.28 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  28.38 
 
 
994 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  29.17 
 
 
531 aa  72.4  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  33.7 
 
 
692 aa  70.5  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  30.15 
 
 
508 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  33.15 
 
 
1780 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  28.11 
 
 
766 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  29.9 
 
 
954 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  30.29 
 
 
993 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  29.79 
 
 
1012 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  29.17 
 
 
772 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  29.38 
 
 
1088 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  26.14 
 
 
565 aa  65.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.17 
 
 
354 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  29.32 
 
 
643 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  32 
 
 
760 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  28.92 
 
 
755 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  28.11 
 
 
765 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  26.14 
 
 
863 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  28.11 
 
 
779 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  28.41 
 
 
542 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  28.92 
 
 
766 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  29.81 
 
 
760 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.4 
 
 
1041 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  25.69 
 
 
421 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  27.16 
 
 
789 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  27.16 
 
 
789 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  31.92 
 
 
925 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  27.41 
 
 
1335 aa  59.3  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  31.5 
 
 
1011 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.35 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  26.72 
 
 
877 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  27.66 
 
 
935 aa  57  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  31.58 
 
 
1744 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  23.32 
 
 
1344 aa  53.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  31.37 
 
 
937 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  27.88 
 
 
1085 aa  53.1  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  26.7 
 
 
765 aa  52.8  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  32.06 
 
 
620 aa  52.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.72 
 
 
892 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  27.12 
 
 
400 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  30.23 
 
 
587 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  34.94 
 
 
535 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  27.27 
 
 
1290 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  27.1 
 
 
692 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35741  predicted protein  30.41 
 
 
1370 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  28.57 
 
 
482 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  26.09 
 
 
388 aa  49.7  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27807  predicted protein  26.9 
 
 
770 aa  49.7  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.555868 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  25.17 
 
 
197 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  29.08 
 
 
399 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  29.96 
 
 
1015 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  30.46 
 
 
439 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  30.59 
 
 
447 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.27 
 
 
472 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  25.45 
 
 
2132 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29338  predicted protein  29.38 
 
 
440 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.196261  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.78 
 
 
476 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  32.03 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  26.7 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  32 
 
 
539 aa  47  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  30.67 
 
 
416 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  27.22 
 
 
399 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  29.26 
 
 
618 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  28.39 
 
 
1059 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5305  predicted protein  29.65 
 
 
230 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.860325  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  34.09 
 
 
2324 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  27.73 
 
 
858 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  27.45 
 
 
972 aa  46.2  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.57 
 
 
886 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  24.26 
 
 
277 aa  46.2  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  25.84 
 
 
1024 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  31.46 
 
 
230 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  25.58 
 
 
204 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  29.15 
 
 
2491 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
421 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  26.79 
 
 
528 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  24.31 
 
 
386 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  23.94 
 
 
718 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  27.13 
 
 
498 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  33.12 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  25.59 
 
 
440 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6692  predicted protein  28.19 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283968  hitchhiker  0.00751266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  35.24 
 
 
647 aa  43.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.33 
 
 
867 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>