246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14403 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_14403  phospholipase  100 
 
 
359 aa  726    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990038  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1764  predicted protein  52.76 
 
 
389 aa  360  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289242  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22353  predicted protein  34.99 
 
 
464 aa  203  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04380  monovalent inorganic cation transporter, putative  35.06 
 
 
698 aa  177  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02288  sodium ion/proton exchanger (Eurofung)  34.32 
 
 
703 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78097  monovalent cation:H+ antiporter, CPA1 family (NHX1)  33.08 
 
 
653 aa  172  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.147084  normal  0.966822 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2316  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  34.15 
 
 
357 aa  170  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967211  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1871  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  35.26 
 
 
427 aa  166  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43552  predicted protein  27.36 
 
 
971 aa  117  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774573  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3633  sodium/hydrogen exchanger  27.82 
 
 
531 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544202  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2041  Sodium/hydrogen exchanger  28.49 
 
 
520 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3408  Na+/H+ antiporter NhaP  25.24 
 
 
399 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.435217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0811  Na+/H+ antiporter  27.5 
 
 
527 aa  94  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4011  Na+/H+ antiporter  28.61 
 
 
521 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276255 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0211  Na+/H+ antiporter  24.04 
 
 
526 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0975  Na+/H+ antiporter  24.04 
 
 
526 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1388  Na+/H+ antiporter  24.04 
 
 
526 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1585  Na+/H+ antiporter  24.04 
 
 
526 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0244  Na+/H+ antiporter  24.04 
 
 
526 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2552  Na+/H+ antiporter  24.04 
 
 
526 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2698  Na+/H+ antiporter  24.04 
 
 
526 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3528  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 
410 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339739  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43052  predicted protein  23.33 
 
 
704 aa  87  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0534  sodium/hydrogen exchanger  26.18 
 
 
424 aa  86.3  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0303628 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0496  Na+/H+ antiporter  23.22 
 
 
526 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0546  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  26.47 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0433  sodium/hydrogen exchanger  23.16 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3823  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6974  Na+/H+ antiporter  24.45 
 
 
528 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000126561  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3351  sodium/hydrogen exchanger  27.59 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3825  sodium/hydrogen exchanger  25.75 
 
 
680 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2253  Na+/H+ antiporter  23.76 
 
 
526 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5097  sodium/hydrogen exchanger  24.04 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161414  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6819  Na+/H+ antiporter  24.74 
 
 
524 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388749 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5941  sodium/hydrogen exchanger  28.12 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0629  sodium/hydrogen exchanger  24.78 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.844683 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0702  sodium/hydrogen exchanger  28.17 
 
 
431 aa  79.3  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.429987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1993  sodium/hydrogen exchanger  24.57 
 
 
424 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0366  Na+/H+ antiporter NhaP  25.93 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2454  Na+/H+ antiporter  26.04 
 
 
533 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2078  Na+/H+ antiporter  26.04 
 
 
533 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.886185  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1220  Na+/H+ antiporter NhaP  24.56 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2874  Na+/H+ antiporter  24.59 
 
 
531 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000139579  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5869  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360041  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0652  Na+/H+ antiporter  26.48 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2140  hypothetical protein  26.75 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.387464 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0159  Sodium/hydrogen exchanger  24.93 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1902  Na+/H+ antiporter NhaP  24.68 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0607816  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2566  Na+/H+ antiporter  23.98 
 
 
526 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6040  sodium/hydrogen exchanger  26.01 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208832  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13620  Na+/H+ antiporter NhaP  23.98 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0680  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 
705 aa  73.6  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0621  Na+/H+ antiporter  23.41 
 
 
535 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.547216  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0253  sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4948  Na+/H+ antiporter  23.82 
 
 
527 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3919  cyclic nucleotide-binding protein  26.27 
 
 
682 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4062  sodium/hydrogen exchanger  24.46 
 
 
425 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000359855  normal  0.100381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4810  Sodium/hydrogen exchanger  23.36 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0379  Na+/H+ antiporter  25 
 
 
531 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  26.21 
 
 
832 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6240  Na+/H+ antiporter  23.24 
 
 
537 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.972993  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2310  Na+/H+ antiporter  25.69 
 
 
527 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0582  Na+/H+ antiporter  24.58 
 
 
538 aa  69.3  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.373273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5804  sodium/hydrogen exchanger  21.81 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0577051  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3319  Na+/H+ antiporter  26.78 
 
 
624 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5078  sodium/hydrogen exchanger  22.69 
 
 
829 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1916  sodium/hydrogen exchanger  24.84 
 
 
526 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549793  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4985  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0820317  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1895  sodium/hydrogen exchanger  24.21 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.554149 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0323  sodium/hydrogen exchanger  24.78 
 
 
434 aa  67  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2245  Na+/H+ antiporter, putative  24.21 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207208  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10409  predicted protein  25.75 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31800  Na+/H+ antiporter NhaP protein  23.1 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5277  Sodium/hydrogen exchanger  22.65 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.32 
 
 
434 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4298  sodium/hydrogen exchanger  25.43 
 
 
626 aa  66.2  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.282617  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0398  Na+/H+ antiporter  25.79 
 
 
417 aa  66.2  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0744665  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0183  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  23.2 
 
 
528 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496587 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2911  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3769  Na+/H+ antiporter  23.39 
 
 
527 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4495  sodium/hydrogen exchanger  25.15 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434433  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1783  Na+/H+ antiporter  25.09 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146431  normal  0.0568049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0636  cyclic nucleotide-binding protein  26.35 
 
 
812 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4579  Na+/H+ antiporter  24.4 
 
 
527 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2829  sodium/hydrogen exchanger  26.21 
 
 
434 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3784  Na+/H+ antiporter  24.4 
 
 
527 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  0.143517 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2807  putative Na+/H+ antiporter  25.43 
 
 
444 aa  64.7  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.70387  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0903  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 
525 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1268  sodium/hydrogen exchanger  24.32 
 
 
526 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3739  Na+/H+ antiporter  24.4 
 
 
527 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810076  normal  0.126729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.21 
 
 
389 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3676  Na+/H+ antiporter  25.29 
 
 
527 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0325  Na+/H+ antiporter  24.66 
 
 
537 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.0465423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0940  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 
525 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10336  normal  0.23886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4974  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 
411 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24958  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1777  Na(+)/H(+) antiporter NhaP  25.16 
 
 
417 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105994  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3572  Na+/H+ antiporter  29.87 
 
 
624 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0909  sodium/hydrogen exchanger  23.97 
 
 
526 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5511  Na+/H+ antiporter  25.3 
 
 
527 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1391  sodium/hydrogen exchanger  23.97 
 
 
526 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>