More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14260 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_14260  predicted protein  100 
 
 		 163 aa  340  4e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18502  predicted protein  75.62 
 
 		 167 aa  262  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0613487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  77.27 
 
 		 161 aa  249  9.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  73.12 
 
 		 162 aa  248  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  73.75 
 
 		 163 aa  248  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1187  NADH dehydrogenase subunit I  73.08 
 
 		 164 aa  243  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.438944  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  74.36 
 
 		 273 aa  243  9e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0898  NADH dehydrogenase subunit I  71.25 
 
 		 163 aa  242  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0754  NADH dehydrogenase subunit I  71.79 
 
 		 164 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.180315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1011  NADH dehydrogenase subunit I  70.62 
 
 		 162 aa  239  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.566427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2238  NADH dehydrogenase subunit I  69.87 
 
 		 163 aa  239  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.180184 
 
 
-
 
NC_004310  BR0810  NADH dehydrogenase subunit I  69.38 
 
 		 163 aa  238  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3290  NADH dehydrogenase subunit I  71.97 
 
 		 162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221287  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1322  NADH dehydrogenase subunit I  71.15 
 
 		 164 aa  238  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323962  normal  0.0547108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  70 
 
 		 162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  69.18 
 
 		 162 aa  238  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0805  NADH dehydrogenase subunit I  69.38 
 
 		 163 aa  237  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1723  NADH dehydrogenase subunit I  68.75 
 
 		 163 aa  237  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341479  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1206  NADH dehydrogenase subunit I  70 
 
 		 162 aa  237  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1077  NADH dehydrogenase subunit I  70 
 
 		 162 aa  237  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.280148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  69.38 
 
 		 162 aa  237  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1997  NADH dehydrogenase subunit I  70.51 
 
 		 167 aa  237  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  71.97 
 
 		 162 aa  237  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2523  NADH dehydrogenase subunit I  69.23 
 
 		 167 aa  236  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  70 
 
 		 162 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2415  NADH dehydrogenase subunit I  69.62 
 
 		 163 aa  236  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1185  NADH dehydrogenase subunit I  69.23 
 
 		 167 aa  236  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0684834  normal  0.389473 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  70 
 
 		 162 aa  235  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  68.75 
 
 		 162 aa  235  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  70 
 
 		 163 aa  235  2e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  72.73 
 
 		 162 aa  235  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  69.38 
 
 		 162 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  69.38 
 
 		 162 aa  235  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1301  NADH dehydrogenase subunit I  75.97 
 
 		 162 aa  235  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00320411  normal  0.488956 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05703  hypothetical protein similar to : Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (Broad)  69.81 
 
 		 224 aa  234  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  68.75 
 
 		 162 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1361  NADH dehydrogenase subunit I  69.38 
 
 		 163 aa  233  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0929  NADH dehydrogenase subunit I  69.18 
 
 		 163 aa  233  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1030  NADH dehydrogenase subunit I  69.38 
 
 		 163 aa  233  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1363  NADH dehydrogenase subunit I  69.18 
 
 		 162 aa  231  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.353821  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88630  mitochondrial complex I NUIM TYKY subunit (proton translocation)  66.67 
 
 		 226 aa  230  6e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.970128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2390  NADH dehydrogenase subunit I  68.12 
 
 		 162 aa  229  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000573568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2926  NADH dehydrogenase subunit I  67.5 
 
 		 162 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2824  NADH dehydrogenase subunit I  73.33 
 
 		 164 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.704342  normal  0.0688011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2993  NADH dehydrogenase subunit I  73.1 
 
 		 161 aa  228  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1269  NADH dehydrogenase subunit I  71.81 
 
 		 163 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  66.67 
 
 		 169 aa  223  6e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  75.37 
 
 		 169 aa  219  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  74.63 
 
 		 167 aa  217  5e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0820  NADH dehydrogenase subunit I  76.15 
 
 		 160 aa  207  6e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  59.21 
 
 		 165 aa  191  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  59.21 
 
 		 162 aa  190  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1099  NADH dehydrogenase subunit I  57.79 
 
 		 162 aa  189  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  58.55 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2053  NADH dehydrogenase subunit I  57.89 
 
 		 163 aa  187  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.330204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  57.89 
 
 		 162 aa  187  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  57.89 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  58.55 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  58.75 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  56.17 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  55.62 
 
 		 163 aa  184  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  54.72 
 
 		 162 aa  183  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2054  NADH dehydrogenase subunit I  57.24 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  54.72 
 
 		 162 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2206  NADH dehydrogenase subunit I  57.24 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1883  NADH dehydrogenase subunit I  57.24 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.604396 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  54.32 
 
 		 163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3502  NADH dehydrogenase subunit I  55.92 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  54.09 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0969  NADH dehydrogenase subunit I  57.24 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0765514  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2622  NADH dehydrogenase subunit I  55.92 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2249  NADH dehydrogenase subunit I  55.92 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.650546  hitchhiker  0.0000391532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  55.21 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0965  NADH dehydrogenase subunit I  57.89 
 
 		 170 aa  180  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.837483  normal  0.0693949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1501  NADH dehydrogenase subunit I  55.92 
 
 		 177 aa  180  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0649483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  55.84 
 
 		 162 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0880  NADH dehydrogenase subunit I  57.89 
 
 		 170 aa  180  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.79 
 
 		 162 aa  180  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5172  NADH dehydrogenase subunit I  57.24 
 
 		 169 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.950727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  55.19 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1821  NADH dehydrogenase subunit I  55.19 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1443  NADH dehydrogenase subunit I  55.19 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.798759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  55.19 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0421  NADH dehydrogenase subunit I  55.19 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.735915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  55.19 
 
 		 162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  54.55 
 
 		 162 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  59.29 
 
 		 162 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0935  NADH dehydrogenase subunit I  55.92 
 
 		 163 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1509  NADH dehydrogenase subunit I  60 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  58.57 
 
 		 162 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  58.57 
 
 		 162 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  58.57 
 
 		 162 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  57.86 
 
 		 162 aa  173  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  57.86 
 
 		 162 aa  173  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  57.86 
 
 		 162 aa  173  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0716  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  61.03 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.479335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2805  NADH dehydrogenase subunit I  59.12 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1757  NADH dehydrogenase subunit I  53.75 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2557  NADH dehydrogenase subunit I  58.57 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.840778  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1271  NADH dehydrogenase subunit I  55.63 
 
 		 171 aa  170  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400573  normal  0.480107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>