62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14090 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  100 
 
 
219 aa  446  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  47.62 
 
 
553 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  47.62 
 
 
553 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  30.49 
 
 
797 aa  96.3  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  35.09 
 
 
952 aa  94.4  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  34.26 
 
 
1077 aa  91.3  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  36.77 
 
 
754 aa  89  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  39.34 
 
 
1999 aa  85.9  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  40.32 
 
 
795 aa  84.7  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  41.03 
 
 
479 aa  83.6  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  37.04 
 
 
655 aa  82  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  30.32 
 
 
1090 aa  82  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  44.17 
 
 
466 aa  82  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  30.22 
 
 
2245 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  33.33 
 
 
716 aa  78.2  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  34.97 
 
 
650 aa  78.2  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  41.38 
 
 
268 aa  78.2  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  34.97 
 
 
650 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  35.25 
 
 
633 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  34.53 
 
 
643 aa  76.6  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  33.09 
 
 
633 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  28.33 
 
 
636 aa  75.5  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  28.21 
 
 
636 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  33.09 
 
 
633 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  35.96 
 
 
1189 aa  71.6  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  35.37 
 
 
934 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  41.3 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  27.78 
 
 
635 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  32.86 
 
 
611 aa  67.8  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  31.97 
 
 
902 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  36.7 
 
 
633 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  38.79 
 
 
622 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33296  predicted protein  27.62 
 
 
634 aa  64.3  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  31.88 
 
 
464 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  43.96 
 
 
315 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  27.97 
 
 
632 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  34.31 
 
 
521 aa  63.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  38.79 
 
 
622 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  38.79 
 
 
619 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  34.75 
 
 
986 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  31.87 
 
 
748 aa  60.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  34.58 
 
 
1108 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  34.48 
 
 
1099 aa  58.9  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  30.89 
 
 
902 aa  57.4  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  26.56 
 
 
686 aa  57.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  32.12 
 
 
609 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  37.07 
 
 
651 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  34.41 
 
 
901 aa  51.6  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.2 
 
 
752 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.43 
 
 
585 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 
2310 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  34.04 
 
 
606 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  30 
 
 
1038 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  32.29 
 
 
715 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  29.63 
 
 
941 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  32 
 
 
1653 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  33.68 
 
 
1097 aa  45.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  26.39 
 
 
1111 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.76 
 
 
1203 aa  45.1  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  30.85 
 
 
486 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  29.84 
 
 
1585 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  32.76 
 
 
1126 aa  41.6  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0708139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>