More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13757 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_13757  predicted protein  100 
 
 
115 aa  241  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.251345  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  43.56 
 
 
142 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  43.52 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  44.74 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  42.61 
 
 
136 aa  92  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  45.22 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  44.9 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  42.74 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  45.05 
 
 
169 aa  90.5  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  40.87 
 
 
190 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  43.56 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  43.93 
 
 
135 aa  87.4  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  43.88 
 
 
138 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  43.88 
 
 
137 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  48.98 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  42.86 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  45.36 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  42.86 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  44.79 
 
 
131 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  41.58 
 
 
142 aa  84.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  44.33 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  41.84 
 
 
137 aa  84.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  42.24 
 
 
171 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  40.74 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  45.1 
 
 
161 aa  84  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  41.59 
 
 
165 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  41.84 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  43.1 
 
 
138 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  37.07 
 
 
133 aa  83.6  9e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  41.12 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  43.3 
 
 
176 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  44 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  41.59 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  47.96 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  44.9 
 
 
171 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  43.88 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  47.96 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  41.24 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  43.88 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  40.82 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  40.82 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  44.9 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  43.93 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  47.25 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  38.94 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  42.06 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0879  methionine-R-sulfoxide reductase  41.84 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.950161  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4333  methionine-R-sulfoxide reductase  40 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  41.23 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  42.11 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  41.51 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  44.44 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  39.58 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  39.58 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  39.58 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  39.58 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  40.57 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  42.11 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  39.58 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  43.56 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  39.58 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  39.58 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  44.19 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  44.19 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  44.19 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  39.58 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  44.19 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  39.64 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  41.67 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  44.19 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  45.83 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  43.88 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  43.88 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  43.88 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  37.84 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  40.74 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  40.59 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  37.04 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  40.59 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  45.65 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  43.3 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  42.57 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  42.61 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  38.26 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  39.25 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  38.21 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  44.79 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  42.86 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  43.88 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  42.45 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  39.83 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  41.23 
 
 
167 aa  77  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  45.65 
 
 
155 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  42 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  47.83 
 
 
164 aa  77  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2727  methionine sulfoxide reductase B  35.78 
 
 
137 aa  76.6  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00340114  hitchhiker  0.000973633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  39.13 
 
 
164 aa  77  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  44.9 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  37.76 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>