More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13725 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_13725  predicted protein  100 
 
 
397 aa  813    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.829613  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31131  predicted protein  41.93 
 
 
443 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  41.01 
 
 
397 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  42.39 
 
 
396 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  40.3 
 
 
398 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  41.33 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  42.53 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  40.31 
 
 
405 aa  273  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  40.72 
 
 
405 aa  273  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  39.8 
 
 
423 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  41.42 
 
 
393 aa  272  7e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  40.51 
 
 
390 aa  272  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  38.54 
 
 
397 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  41.01 
 
 
408 aa  272  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  39.25 
 
 
380 aa  270  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  41.54 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  41.09 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  38.13 
 
 
396 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  41.09 
 
 
403 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  39.8 
 
 
387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  40.3 
 
 
386 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  39.75 
 
 
387 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  37.88 
 
 
396 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  40.1 
 
 
397 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  40.25 
 
 
402 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  41.54 
 
 
387 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  41.04 
 
 
398 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  37.37 
 
 
396 aa  265  8e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  38.23 
 
 
397 aa  265  8e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  38.07 
 
 
396 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  40.46 
 
 
395 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  38.25 
 
 
404 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  40.72 
 
 
384 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  39.49 
 
 
398 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  41.39 
 
 
404 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  41.98 
 
 
385 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  41.28 
 
 
387 aa  263  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  38.5 
 
 
401 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  40.57 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  39.49 
 
 
387 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  39.75 
 
 
403 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  37.47 
 
 
400 aa  262  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  39.35 
 
 
388 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  38.25 
 
 
401 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3056  amidohydrolase  41.65 
 
 
387 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  40.41 
 
 
395 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  38.15 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  38.79 
 
 
398 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.44 
 
 
381 aa  259  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  39.85 
 
 
390 aa  259  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  38.75 
 
 
397 aa  259  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  40.16 
 
 
395 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  40.16 
 
 
395 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  39.13 
 
 
405 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  38.94 
 
 
399 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  39.49 
 
 
398 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  38.94 
 
 
381 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  39.55 
 
 
405 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  38.94 
 
 
401 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  40.1 
 
 
381 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  39.39 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  38.99 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  40 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  38.69 
 
 
381 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0634  carboxypeptidase  36.52 
 
 
396 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.062973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  39.54 
 
 
386 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  39.9 
 
 
389 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  39.04 
 
 
381 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  38.44 
 
 
381 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  40.77 
 
 
387 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  38.6 
 
 
425 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  38.35 
 
 
402 aa  251  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  41.56 
 
 
388 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0708  carboxypeptidase  36.02 
 
 
396 aa  250  3e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  41.9 
 
 
387 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  37.88 
 
 
397 aa  249  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1065  carboxypeptidase  36.02 
 
 
396 aa  249  5e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.094231  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  37.97 
 
 
379 aa  249  8e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  36.08 
 
 
393 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  38.83 
 
 
394 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  40.91 
 
 
373 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  40 
 
 
388 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  40 
 
 
388 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  38.15 
 
 
388 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  40.05 
 
 
384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  38.27 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 
387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1291  peptidase M20D, amidohydrolase  38.52 
 
 
391 aa  245  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.214577  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  38.89 
 
 
382 aa  245  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  38.94 
 
 
393 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  35.82 
 
 
398 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  38.64 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  38.5 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  38.68 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  38.54 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  38.42 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2348  peptidase M20D, amidohydrolase  38.25 
 
 
399 aa  243  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  37.72 
 
 
396 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  39.25 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  35.57 
 
 
398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>