144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13721 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_13721  predicted protein  100 
 
 
136 aa  282  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33850  predicted protein  46.88 
 
 
240 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08847  phosducin-like protein (Eurofung)  42.55 
 
 
232 aa  92.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35416  predicted protein  34.35 
 
 
220 aa  87.8  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15411  normal  0.0272951 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04220  GTPase inhibitor, putative  33.61 
 
 
225 aa  85.1  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.944407  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37090  predicted protein  40.26 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30502  predicted protein  29.8 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00834692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  33.72 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  33.33 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  25.2 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  30.68 
 
 
102 aa  50.4  0.000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  28.89 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  31.25 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  23.66 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  33.73 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  25 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14280  thioredoxin  29.89 
 
 
102 aa  47.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.978477  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  31.88 
 
 
104 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  31.88 
 
 
104 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  31.88 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  32.89 
 
 
105 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  31.4 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  30.43 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  26.67 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  28.09 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  29.73 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  32.86 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0459  Thioredoxin domain protein  33.77 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0621095  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01200  thioredoxin (trx), putative  26.32 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954839  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  27.78 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2011  thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  27.78 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  27.78 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1436  thioredoxin  27.27 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  32.89 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  29.73 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  28.74 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  29.21 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  29.73 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  32.89 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  32.89 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  28.57 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  28.4 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  30 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  24.44 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  28.57 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  30.26 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  25.42 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  30.26 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  22.73 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  25.68 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  25.68 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  19.78 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  31.08 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  25.58 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.17 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  31.17 
 
 
285 aa  43.5  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.27 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2156  thioredoxin family protein  27.06 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  27.59 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2311  thioredoxin family protein  27.06 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0894  thioredoxin 1  34.09 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0704884  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  29.85 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9748  predicted protein  28.21 
 
 
108 aa  42.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.82657  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  28.74 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10788  predicted protein  26.37 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5085  thioredoxin  29.03 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  28.38 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  27.03 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  28.38 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  30 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  27.59 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0483  thioredoxin, putative  23.66 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  42 
 
 
600 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  27.14 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  25.58 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  26.51 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  25.58 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  29.58 
 
 
241 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  36.84 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  24.18 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2121  Thioredoxin domain protein  26.44 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.427267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  28.41 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0589  thioredoxin domain-containing protein  27.14 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  26.44 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  29.03 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4233  thioredoxin  31.08 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3164  Thioredoxin domain protein  30.34 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  28.95 
 
 
290 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  27.14 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  29.58 
 
 
108 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  26.14 
 
 
106 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  24.14 
 
 
107 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  27.27 
 
 
146 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  26.09 
 
 
105 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  24.14 
 
 
109 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  26.14 
 
 
109 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  21.98 
 
 
105 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  24.42 
 
 
107 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  29.23 
 
 
130 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>