16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13662 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_13662  predicted protein  100 
 
 
570 aa  1170    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29586  predicted protein  47.04 
 
 
624 aa  543  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120128  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26299  predicted protein  31.79 
 
 
619 aa  333  5e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415226  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47670  tocopherol cyclase  34.08 
 
 
622 aa  327  3e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23908  predicted protein  31.91 
 
 
639 aa  319  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0896713  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22145  predicted protein  33.45 
 
 
585 aa  293  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183468  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42002  predicted protein  28.74 
 
 
626 aa  282  9e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.707722  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12587  predicted protein  29.7 
 
 
617 aa  279  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.091239  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25752  predicted protein  29.52 
 
 
650 aa  277  4e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00880  conserved hypothetical protein  29.64 
 
 
626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225651  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66462  predicted protein  29.92 
 
 
636 aa  259  1e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05450  multispanning membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13430)  27.36 
 
 
699 aa  202  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475774 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50995  predicted protein  23.86 
 
 
664 aa  164  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.680545 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47564  predicted protein  24.03 
 
 
682 aa  77  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2291  diguanylate cyclase  31.31 
 
 
651 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2566  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.31 
 
 
649 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0181477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>