More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13581 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05406  DNA topoisomerase 2 (EC 5.99.1.3) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59864]  39.44 
 
 		 1709 aa  803    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0595729  normal  0.152073 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13581  predicted protein  100 
 
 		 1165 aa  2424    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03600  DNA topoisomerase II, putative  42.03 
 
 		 1272 aa  855    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0488595  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41836  predicted protein  46.32 
 
 		 1292 aa  986    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.107242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74317  DNA topoisomerase II  39.65 
 
 		 1439 aa  828    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_52174  predicted protein  42.35 
 
 		 1143 aa  885    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338516  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1622  DNA gyrase, B subunit  26.22 
 
 		 786 aa  161  8e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  25.69 
 
 		 642 aa  159  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2134  DNA topoisomerase IV subunit B  26.88 
 
 		 702 aa  159  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  24.67 
 
 		 644 aa  155  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0947  DNA topoisomerase IV subunit B  26.52 
 
 		 630 aa  155  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.798803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  27.13 
 
 		 628 aa  154  8.999999999999999e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2101  DNA topoisomerase IV, B subunit  27.29 
 
 		 628 aa  154  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.846279 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  25.36 
 
 		 637 aa  153  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  25.79 
 
 		 636 aa  152  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3307  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  26.87 
 
 		 701 aa  151  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  26.47 
 
 		 635 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  25.79 
 
 		 636 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43480  DNA topoisomerase IV subunit B  27.94 
 
 		 630 aa  149  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65660  DNA topoisomerase IV subunit B  28.21 
 
 		 629 aa  149  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2123  DNA topoisomerase IV subunit B  27.04 
 
 		 640 aa  149  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.59022  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3554  DNA topoisomerase IV subunit B  28.91 
 
 		 632 aa  149  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1753  DNA topoisomerase IV, B subunit  28.07 
 
 		 638 aa  149  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2794  DNA topoisomerase IV subunit B  27.5 
 
 		 631 aa  149  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197709  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3558  DNA topoisomerase IV subunit B  26.45 
 
 		 631 aa  148  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0279  DNA topoisomerase IV subunit B  25.98 
 
 		 631 aa  148  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0578  DNA topoisomerase IV subunit B  25.98 
 
 		 631 aa  148  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0659  DNA topoisomerase IV subunit B  25.98 
 
 		 631 aa  148  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.59712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5696  DNA topoisomerase IV subunit B  28.05 
 
 		 629 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.976581  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0604  DNA topoisomerase IV subunit B  27.3 
 
 		 632 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  25.9 
 
 		 645 aa  147  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  24.34 
 
 		 643 aa  147  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  25.25 
 
 		 633 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0599  DNA topoisomerase IV subunit B  25.18 
 
 		 630 aa  146  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  24.93 
 
 		 660 aa  146  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  25.07 
 
 		 635 aa  145  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  27.04 
 
 		 627 aa  145  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3772  DNA topoisomerase IV subunit B  26 
 
 		 631 aa  145  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  25.94 
 
 		 634 aa  145  5e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2043  DNA topoisomerase IV subunit B  26.02 
 
 		 641 aa  144  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4707  DNA topoisomerase IV subunit B  26.55 
 
 		 634 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.590641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0435  DNA topoisomerase IV subunit B  26.16 
 
 		 629 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0005  DNA gyrase subunit B  26.21 
 
 		 804 aa  144  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02902  DNA topoisomerase IV subunit B  25.47 
 
 		 630 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0670  DNA topoisomerase IV, B subunit  25.47 
 
 		 630 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3494  DNA topoisomerase IV subunit B  25.47 
 
 		 630 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  23.88 
 
 		 644 aa  143  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  26.81 
 
 		 678 aa  143  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02852  hypothetical protein  25.47 
 
 		 630 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  24.92 
 
 		 645 aa  143  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4190  DNA topoisomerase IV subunit B  26.33 
 
 		 631 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218544 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3208  DNA topoisomerase IV subunit B  25.47 
 
 		 630 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0667  DNA topoisomerase IV subunit B  25.47 
 
 		 630 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.428879  decreased coverage  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0319  DNA gyrase, B subunit  25.57 
 
 		 814 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3463  DNA topoisomerase IV subunit B  25.47 
 
 		 630 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0003  DNA gyrase subunit B  26.94 
 
 		 769 aa  142  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0499  DNA topoisomerase IV subunit B  26.18 
 
 		 635 aa  142  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4344  DNA topoisomerase IV subunit B  25.47 
 
 		 630 aa  142  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  24.35 
 
 		 640 aa  142  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0779  DNA topoisomerase IV subunit B  26.59 
 
 		 628 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.257119  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4915  DNA topoisomerase IV subunit B  26.39 
 
 		 634 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  25.5 
 
 		 630 aa  142  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03685  DNA topoisomerase IV subunit B  25.94 
 
 		 631 aa  142  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3443  DNA topoisomerase IV subunit B  25.35 
 
 		 630 aa  142  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.411939  normal  0.211337 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3432  DNA topoisomerase IV subunit B  25.5 
 
 		 630 aa  142  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  26.48 
 
 		 633 aa  142  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  25.5 
 
 		 630 aa  142  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0132  DNA topoisomerase IV subunit B  25.86 
 
 		 636 aa  142  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000115849  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  25.5 
 
 		 630 aa  142  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2768  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  25.16 
 
 		 650 aa  141  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  26.77 
 
 		 769 aa  141  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  26.51 
 
 		 654 aa  141  7.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0006  DNA gyrase, B subunit  26.07 
 
 		 871 aa  141  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.44586  hitchhiker  0.00403609 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3367  DNA topoisomerase IV subunit B  25.5 
 
 		 630 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4791  DNA topoisomerase IV subunit B  26.39 
 
 		 634 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3325  DNA topoisomerase IV subunit B  25.27 
 
 		 630 aa  140  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707036 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0004  DNA gyrase subunit B  25.89 
 
 		 871 aa  140  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0729554  hitchhiker  0.0000403413 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  24.01 
 
 		 637 aa  140  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  25.29 
 
 		 634 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  26.09 
 
 		 652 aa  140  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  26.77 
 
 		 769 aa  140  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4263  DNA topoisomerase IV subunit B  25.76 
 
 		 631 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00013039 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  25.86 
 
 		 641 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  26.2 
 
 		 650 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  26.43 
 
 		 643 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4968  DNA topoisomerase IV subunit B  26.23 
 
 		 634 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.713463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  26.78 
 
 		 644 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1446  DNA topoisomerase IV subunit B  27.84 
 
 		 629 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0951751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0005  DNA gyrase, B subunit  25.09 
 
 		 884 aa  139  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000126845  hitchhiker  0.0000000317646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2544  DNA topoisomerase IV subunit B  25.86 
 
 		 626 aa  139  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0730  DNA topoisomerase IV subunit B  26.09 
 
 		 628 aa  139  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0811  DNA topoisomerase IV subunit B  26.89 
 
 		 628 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000501954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0818  DNA topoisomerase IV subunit B  26.89 
 
 		 628 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3573  DNA topoisomerase IV subunit B  26.89 
 
 		 628 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3220  DNA topoisomerase IV subunit B  27.6 
 
 		 628 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.128884  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0786  DNA topoisomerase IV subunit B  26.89 
 
 		 628 aa  138  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  23.87 
 
 		 649 aa  138  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0003  DNA gyrase subunit B  28.01 
 
 		 772 aa  137  8e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  25.54 
 
 		 632 aa  138  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  24.77 
 
 		 653 aa  137  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>