78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13557 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_13557  proly 4-hydroxylase  100 
 
 
226 aa  476  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.428415  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_6831  predicted protein  42.79 
 
 
255 aa  143  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554731  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37480  predicted protein  40.44 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37102  predicted protein  36.04 
 
 
328 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000800268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4348  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.48 
 
 
216 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4090  2OG-Fe(II) oxygenase  34.98 
 
 
216 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0892  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.98 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4459  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  34.48 
 
 
216 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4138  prolyl 4-hydroxylase subunit alpha  34.48 
 
 
232 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.769007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4256  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.48 
 
 
216 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3988  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  34.48 
 
 
232 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.591801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3978  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  35.78 
 
 
232 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4367  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit domain protein  34.48 
 
 
216 aa  124  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4314  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  33.99 
 
 
216 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42939  predicted protein  33.93 
 
 
309 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.022844  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87339  predicted protein  31.06 
 
 
317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2649  Procollagen-proline dioxygenase  33.33 
 
 
288 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3059  Procollagen-proline dioxygenase  33.33 
 
 
288 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739121  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33329  predicted protein  34.78 
 
 
508 aa  114  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410276  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3098  2OG-Fe(II) oxygenase  34.13 
 
 
293 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2950  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  32.72 
 
 
282 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2814  hypothetical protein  32.85 
 
 
289 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510107  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_6080  predicted protein  32.14 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1171  2OG-Fe(II) oxygenase  33.99 
 
 
309 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3712  procollagen-proline, 2-oxoglutarate-4-dioxygenase  34.6 
 
 
277 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115157  normal  0.250522 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2795  Procollagen-proline dioxygenase  33.02 
 
 
575 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5329  procollagen-proline dioxygenase  33.65 
 
 
305 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2651  procollagen-proline dioxygenase  34.48 
 
 
287 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5284  procollagen-proline dioxygenase  32.02 
 
 
294 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107996  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1859  procollagen-proline dioxygenase  30.14 
 
 
268 aa  102  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000240763  hitchhiker  0.00174757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0348  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  31.02 
 
 
296 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470806  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4950  predicted protein  30.23 
 
 
193 aa  99.4  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0332779  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2496  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  32 
 
 
263 aa  97.4  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.274207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3584  Procollagen-proline dioxygenase  31.79 
 
 
296 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1302  Procollagen-proline dioxygenase  31.03 
 
 
279 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2646  Procollagen-proline dioxygenase  32.02 
 
 
289 aa  96.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5409  Procollagen-proline dioxygenase  31.37 
 
 
295 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23734  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3293  2OG-Fe(II) oxygenase  32.02 
 
 
289 aa  95.5  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49409  predicted protein  29.12 
 
 
606 aa  94.7  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34558  predicted protein  31.3 
 
 
225 aa  94  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.822619 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1199  procollagen-proline,2-oxoglutarate-4- dioxygenase  30.88 
 
 
292 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691217  normal  0.470353 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2091  hypothetical protein  33.01 
 
 
289 aa  91.7  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1210  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  32.5 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44137  predicted protein  28.57 
 
 
537 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128731  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_5156  predicted protein  32.21 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10655  predicted protein  29.46 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.451617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  30.41 
 
 
478 aa  89  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3700  response regulator receiver domain-containing protein  30.88 
 
 
269 aa  87.8  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0894  2OG-Fe(II) oxygenase  27.5 
 
 
328 aa  86.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2168  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  30.52 
 
 
277 aa  85.5  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1382  2OG-Fe(II) oxygenase  29.27 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29305  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49523  predicted protein  29.09 
 
 
584 aa  79.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047501  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48891  hypothetical protein  27.8 
 
 
427 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02819  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  27.14 
 
 
376 aa  75.5  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.310762  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86909  predicted protein  28.02 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0454428  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2355  2OG-Fe(II) oxygenase  28.71 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.622795  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1522  2OG-Fe(II) oxygenase  27.14 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  0.97292 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34321  predicted protein  28.44 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0494841  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16363  predicted protein  26.61 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3138  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  28.43 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.645848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2737  2OG-Fe(II) oxygenase  28.43 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.326677  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48887  predicted protein  31.11 
 
 
474 aa  68.6  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42426  predicted protein  26.64 
 
 
473 aa  65.5  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1091  2OG-Fe(II) oxygenase  26.77 
 
 
416 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02851  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family family (AFU_orthologue; AFUA_3G11980)  26.18 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2573  2OG-Fe(II) oxygenase  28.49 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48732  predicted protein  31.16 
 
 
509 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38694  predicted protein  27.05 
 
 
348 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38702  predicted protein  27.05 
 
 
348 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0276  2OG-Fe(II) oxygenase  31.06 
 
 
327 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4463  prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  28.1 
 
 
324 aa  56.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0268  2OG-Fe(II) oxygenase  31.06 
 
 
327 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0272  2OG-Fe(II) oxygenase  31.01 
 
 
327 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44920  predicted protein  25.93 
 
 
417 aa  52.4  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0266  2OG-Fe(II) oxygenase  28.87 
 
 
327 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134192 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9147  predicted protein  31.47 
 
 
137 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_24784  predicted protein  24.53 
 
 
347 aa  45.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000305391  decreased coverage  0.000652774 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44168  predicted protein  23.5 
 
 
431 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>