13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13553 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_13553  predicted protein  100 
 
 
250 aa  512  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0118726  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46998  predicted protein  44.72 
 
 
480 aa  223  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291299  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32929  predicted protein  43.7 
 
 
794 aa  202  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_5491  predicted protein  46.23 
 
 
210 aa  200  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.223661  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36842  predicted protein  34.96 
 
 
762 aa  167  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36848  predicted protein  33.33 
 
 
424 aa  158  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10377  DUF580 domain protein Pns1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12970)  30.77 
 
 
533 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.173426  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34117  predicted protein  30.17 
 
 
516 aa  122  7e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00012281  normal  0.103056 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00640  integral to plasma membrane protein, putative  30.4 
 
 
551 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00800  expressed protein  28.09 
 
 
699 aa  62.8  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27894  predicted protein  21.8 
 
 
566 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.404888  normal  0.456946 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1302  predicted protein  20.59 
 
 
687 aa  45.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.12515  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33567  predicted protein  21.92 
 
 
396 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416798  normal  0.0211717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>