18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13205 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13205  predicted protein  100 
 
 
83 aa  167  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45703  predicted protein  40.58 
 
 
2426 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.235875  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03040  conserved hypothetical protein  41.67 
 
 
1711 aa  54.7  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03280  transcriptional activator gcn5, putative  38.55 
 
 
812 aa  50.8  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45764  predicted protein  33.33 
 
 
1603 aa  50.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40548  predicted protein  37.7 
 
 
455 aa  50.4  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.000000490201  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15581  predicted protein  45.83 
 
 
859 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.251833  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03621  histone acetyltransferase (Gcn5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12650)  36.99 
 
 
414 aa  47.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.128109 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03400  hypothetical protein  37.5 
 
 
873 aa  47  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0021041  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9462  predicted protein  34.78 
 
 
82 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.240558 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54505  predicted protein  41.51 
 
 
1056 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03440  conserved hypothetical protein  27.4 
 
 
634 aa  45.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0637382  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16923  predicted protein  29.55 
 
 
1559 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_2957  predicted protein  32.14 
 
 
338 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7957  predicted protein  28.57 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293834  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_7614  predicted protein  34.62 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42944  predicted protein  26.14 
 
 
1422 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.237933  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01984  protein involved in transcription initiation at TATA-containing promoters (Eurofung)  29.07 
 
 
808 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0109917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>