15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13167 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13167  predicted protein  100 
 
 
222 aa  443  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16341  predicted protein  52.06 
 
 
323 aa  186  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87739  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  38.26 
 
 
358 aa  121  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00752258 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9444  predicted protein  34.31 
 
 
297 aa  104  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34595  UDP-galactose transporter  32.6 
 
 
351 aa  96.7  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.147925 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37524  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  29.36 
 
 
316 aa  94.4  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0090213  decreased coverage  0.000550159 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_3940  predicted protein  30.33 
 
 
268 aa  90.9  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29277  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  28.76 
 
 
356 aa  89  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04068  UDP-galactose transporter homolog 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5W2]  30.38 
 
 
424 aa  84  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.135238 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42638  predicted protein  28.04 
 
 
494 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16401  predicted protein  27.12 
 
 
342 aa  75.5  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43912  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  27.39 
 
 
390 aa  65.1  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353744  normal  0.0272951 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03760  UDP-galactose transporter, putative  26.14 
 
 
412 aa  63.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0327539  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03760  UDP-galactose transporter, putative  26.14 
 
 
412 aa  63.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0662876  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45749  DMT family transporter: UDP-galactose/UDP-glucose  27.64 
 
 
400 aa  62  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>