56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13125 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  100 
 
 		 308 aa  640    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  61.69 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  52.27 
 
 		 311 aa  325  6e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  50.6 
 
 		 364 aa  318  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  50.62 
 
 		 337 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  51.99 
 
 		 317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  51.94 
 
 		 319 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  52.81 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  49.5 
 
 		 314 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  50.5 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  49.01 
 
 		 310 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  51.8 
 
 		 319 aa  298  8e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  48.34 
 
 		 310 aa  298  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  50.17 
 
 		 314 aa  298  9e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  52.48 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  47.45 
 
 		 329 aa  295  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  48.2 
 
 		 320 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  47.35 
 
 		 310 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  51.48 
 
 		 314 aa  289  4e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  49.34 
 
 		 351 aa  288  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  48.36 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  51.37 
 
 		 327 aa  286  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  47.56 
 
 		 322 aa  286  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  50.16 
 
 		 314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  46.67 
 
 		 351 aa  283  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  48.15 
 
 		 352 aa  279  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  47.68 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  49.36 
 
 		 351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  47.19 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  45.02 
 
 		 332 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  43.59 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  43.92 
 
 		 338 aa  255  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  44.27 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  40.53 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  43.4 
 
 		 337 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  42.05 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  44.11 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  43.09 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  42.62 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  42.9 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  43.42 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  43.42 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  41.25 
 
 		 319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  41.25 
 
 		 319 aa  222  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  41.69 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  33.1 
 
 		 800 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  23.87 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 		 489 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2548  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  33.09 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0390  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000824452  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  28.29 
 
 		 354 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>