More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13005 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13005  glutathione peroxidase  100 
 
 
157 aa  327  4e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  44.03 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  45.22 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  39.62 
 
 
165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  42.41 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78456  glutathione peroxidase  42.41 
 
 
160 aa  115  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.437317  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  41.25 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  39.49 
 
 
158 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  38.61 
 
 
161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  44.2 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  39.62 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  37.97 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  38.85 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  41.25 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  38.85 
 
 
162 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  44.2 
 
 
168 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  40.62 
 
 
161 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  38.46 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  42.75 
 
 
161 aa  110  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  38.85 
 
 
159 aa  110  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  39.49 
 
 
158 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  41.13 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  39.62 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  38.22 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  38.36 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  39.86 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  41.22 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  40 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  38.99 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  37.5 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  40.62 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  35.22 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  40 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  39.49 
 
 
165 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  42.03 
 
 
160 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  42.03 
 
 
160 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  40.46 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  41.3 
 
 
160 aa  107  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  40.15 
 
 
157 aa  107  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  39.74 
 
 
167 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  41.3 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  42.03 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  42.03 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  42.03 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  39.62 
 
 
169 aa  107  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  41.73 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  41.3 
 
 
161 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  37.97 
 
 
159 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  37.97 
 
 
159 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  37.34 
 
 
159 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  41.18 
 
 
161 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  37.97 
 
 
159 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  37.97 
 
 
159 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  37.97 
 
 
159 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  37.97 
 
 
159 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  37.97 
 
 
159 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  37.82 
 
 
159 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52875  Hydroperoxide resistance conferring gene. Sensor and transducer of the hydroperoxide signal to Yap1. Hydroperoxide receptor and redox-transducer  38.61 
 
 
185 aa  105  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.187379  normal  0.741014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  37.58 
 
 
160 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  42.96 
 
 
162 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  40.58 
 
 
160 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  38.61 
 
 
164 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  35.44 
 
 
161 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  38.75 
 
 
165 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  38.22 
 
 
165 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  39.71 
 
 
160 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  37.5 
 
 
164 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  39.71 
 
 
160 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  38.36 
 
 
158 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  41.91 
 
 
161 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  40.43 
 
 
163 aa  104  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  41.91 
 
 
161 aa  104  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  36.88 
 
 
161 aa  103  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  38.46 
 
 
185 aa  103  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3106  glutathione peroxidase  40.29 
 
 
167 aa  103  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422985  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  37.5 
 
 
161 aa  103  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  38.75 
 
 
161 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  37.89 
 
 
162 aa  103  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2146  Peroxiredoxin  35 
 
 
160 aa  103  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  35 
 
 
162 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  39.86 
 
 
164 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  37.58 
 
 
165 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  39.57 
 
 
162 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3841  glutathione peroxidase  35 
 
 
162 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0688357  normal  0.342172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  36.88 
 
 
161 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  40.44 
 
 
160 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  40.58 
 
 
164 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  35 
 
 
162 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  38.12 
 
 
161 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  37.5 
 
 
161 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  37.74 
 
 
159 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  37.11 
 
 
161 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  35.85 
 
 
161 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  39.51 
 
 
198 aa  102  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1483  glutathione peroxidase  35 
 
 
162 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  41.91 
 
 
160 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  38.46 
 
 
159 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  39.13 
 
 
162 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  36.54 
 
 
182 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  37.66 
 
 
158 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>