202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12984 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_12984  predicted protein  100 
 
 
96 aa  195  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0223  putative nucleotide sugar epimerase  41 
 
 
340 aa  72  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2847  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.71 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
336 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0191  putative nucleotide sugar epimerase  41 
 
 
339 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.068357  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
336 aa  71.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12841  putative nucleotide sugar epimerase  41 
 
 
345 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.363741  normal  0.0780964 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  42.71 
 
 
337 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.16 
 
 
322 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0330143  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.71 
 
 
342 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25381  putative nucleotide sugar epimerase  40 
 
 
340 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.71 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1681  putative nucleotide sugar epimerase  39 
 
 
348 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.174267  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.46 
 
 
350 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03951  putative nucleotide sugar epimerase  39 
 
 
348 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.658541  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.58 
 
 
337 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 
345 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.170063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  39.58 
 
 
338 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.58 
 
 
335 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.58 
 
 
334 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  39.58 
 
 
339 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 
335 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
358 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.3 
 
 
323 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38 
 
 
321 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.58 
 
 
326 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.89 
 
 
337 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.95 
 
 
334 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
334 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
335 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3576  UDP-glucuronate 5'-epimerase  37.5 
 
 
335 aa  66.6  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.38 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13991  putative nucleotide sugar epimerase  42.86 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.417084  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.58 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  38.95 
 
 
336 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0033  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.54 
 
 
365 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
333 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 
335 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  39.58 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  37.5 
 
 
335 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  37 
 
 
321 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
335 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
338 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
337 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38 
 
 
324 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  37.5 
 
 
336 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.42 
 
 
331 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
337 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13711  putative nucleotide sugar epimerase  38 
 
 
345 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.365086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.58 
 
 
347 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
341 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1471  nucleotide sugar epimerase  36 
 
 
323 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.42 
 
 
335 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  36.46 
 
 
335 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  36.46 
 
 
335 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 
323 aa  64.3  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
327 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.38 
 
 
335 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179561  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  37.89 
 
 
337 aa  64.7  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
335 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
327 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5384  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.46 
 
 
341 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4686  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.46 
 
 
335 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
336 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
335 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.46 
 
 
335 aa  63.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
337 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.550526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
337 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.586684 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.79 
 
 
332 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
335 aa  63.9  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 
324 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
335 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  38.95 
 
 
338 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.46 
 
 
339 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.58 
 
 
337 aa  63.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
335 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
338 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.38 
 
 
333 aa  63.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0803132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
341 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
341 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237866  hitchhiker  0.0000000224121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5586  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.42 
 
 
332 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 
373 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
336 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38 
 
 
324 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
332 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
339 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.73 
 
 
346 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.58 
 
 
339 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.46 
 
 
335 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.58 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.46 
 
 
335 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.46 
 
 
335 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.46 
 
 
335 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.14 
 
 
336 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
330 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.42 
 
 
335 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.5 
 
 
352 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>