More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12813 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12813  predicted protein  100 
 
 
298 aa  624  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42018  predicted protein  99.66 
 
 
320 aa  622  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.953925  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23717  predicted protein  86.91 
 
 
340 aa  562  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.239668  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28333  predicted protein  68.35 
 
 
360 aa  430  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642636  normal  0.462802 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15777  predicted protein  53.18 
 
 
299 aa  319  3.9999999999999996e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.112856  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11651  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  47.85 
 
 
384 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09411  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  46.2 
 
 
366 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0946789 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11811  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  46.86 
 
 
326 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11821  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  46.53 
 
 
321 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.140856  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11131  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  47.84 
 
 
361 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1086  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  46.53 
 
 
370 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.569863  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0675  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  46.86 
 
 
381 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0749  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  47.04 
 
 
398 aa  272  6e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.14944  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15081  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  46.86 
 
 
387 aa  271  7e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459762  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  47.35 
 
 
440 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  0.0000000785266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  47.18 
 
 
405 aa  269  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1917  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  46.23 
 
 
396 aa  269  5e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484005  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.82 
 
 
403 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  47.35 
 
 
439 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.33 
 
 
406 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.33 
 
 
406 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  44.82 
 
 
403 aa  264  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000202848  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.15 
 
 
400 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0890  benzoyl-CoA oxygenase, component A  37.29 
 
 
414 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6638  benzoyl-CoA oxygenase, component A  35.25 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1323  benzoyl-CoA oxygenase, component A  33.22 
 
 
417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1220  benzoyl-CoA oxygenase subunit A  33.11 
 
 
415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.655891  normal  0.0139439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  35.25 
 
 
416 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1424  benzoyl-CoA oxygenase, component A  34.92 
 
 
413 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2694  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  33.56 
 
 
413 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0095  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  35.69 
 
 
428 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2942  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.53 
 
 
427 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.453854  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0072  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  32.65 
 
 
439 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3661  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  36.16 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  33.44 
 
 
426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0734  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.89 
 
 
424 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.44 
 
 
423 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  31.51 
 
 
607 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.51 
 
 
594 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.51 
 
 
599 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.09 
 
 
245 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.83 
 
 
596 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.67 
 
 
599 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.29 
 
 
594 aa  99.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.67 
 
 
599 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.67 
 
 
599 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.83 
 
 
599 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.83 
 
 
604 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.19 
 
 
598 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.83 
 
 
604 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.41 
 
 
604 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  32.92 
 
 
599 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  32.5 
 
 
599 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.83 
 
 
591 aa  96.7  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
883 aa  96.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.83 
 
 
599 aa  95.9  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  32.5 
 
 
599 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  31.67 
 
 
601 aa  95.5  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2512  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.05 
 
 
595 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49097  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  30.54 
 
 
628 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  31.67 
 
 
599 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.96 
 
 
599 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  31.67 
 
 
599 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  30.96 
 
 
599 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  30.67 
 
 
1257 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  31.61 
 
 
1384 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  30.96 
 
 
599 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  31.67 
 
 
599 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.91 
 
 
600 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  31.67 
 
 
599 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  32.08 
 
 
599 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  31.67 
 
 
599 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  32.08 
 
 
599 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  30.54 
 
 
599 aa  93.6  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.22 
 
 
595 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.05 
 
 
605 aa  92.8  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  31.91 
 
 
388 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  34.09 
 
 
554 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1784  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.82 
 
 
589 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.108282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.63 
 
 
595 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.66 
 
 
600 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.05 
 
 
610 aa  90.1  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.25 
 
 
607 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  30.13 
 
 
599 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  31.09 
 
 
1338 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  31.2 
 
 
376 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0218  sulfite reductase subunit alpha  31.4 
 
 
595 aa  88.6  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.180197  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  31.06 
 
 
613 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  30.05 
 
 
1232 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  30.38 
 
 
588 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.38 
 
 
588 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  29.41 
 
 
1396 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  29.92 
 
 
609 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  29.58 
 
 
615 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.36 
 
 
613 aa  86.7  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4136  sulfite reductase  31.54 
 
 
535 aa  85.5  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.9 
 
 
613 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  30.81 
 
 
659 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  29.17 
 
 
600 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.07 
 
 
589 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>