62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12655 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12655  predicted protein  100 
 
 		 260 aa  541  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  35.44 
 
 		 482 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  29.62 
 
 		 412 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5235  predicted protein  28.52 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540131  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  26.17 
 
 		 441 aa  102  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  26 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  25.69 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10848  predicted protein  25.77 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29662  predicted protein  26.13 
 
 		 680 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226582  normal  0.0425728 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  25.89 
 
 		 528 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27248  predicted protein  26.13 
 
 		 680 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.2735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1731  hypothetical protein  32.54 
 
 		 376 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 		 226 aa  52  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.01 
 
 		 503 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12584  glutamine-transport ATP-binding protein ABC transporter glnQ  32.35 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.516819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.05 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4561  predicted protein  32.14 
 
 		 121 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  25.52 
 
 		 425 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.52 
 
 		 425 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 		 454 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  27.34 
 
 		 454 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  28.28 
 
 		 157 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  30.39 
 
 		 577 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  30 
 
 		 169 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10073  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  29.7 
 
 		 330 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0512571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.49 
 
 		 487 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.43 
 
 		 225 aa  46.6  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  26.57 
 
 		 495 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1472  CAAX amino terminal protease family  26.32 
 
 		 381 aa  46.2  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.407531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  35.85 
 
 		 228 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.67 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  26.85 
 
 		 449 aa  45.4  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  28.69 
 
 		 367 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.17 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.42 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.27 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.64 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2053  hypothetical protein  27.08 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.04 
 
 		 408 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  25.71 
 
 		 582 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.4 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2352  cyclic nucleotide-binding protein  27.59 
 
 		 154 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  26.87 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  25.36 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1612  cyclic nucleotide-binding protein  27.59 
 
 		 154 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1517  cyclic nucleotide-binding protein  27.59 
 
 		 154 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  23.03 
 
 		 482 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  23.58 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  23.02 
 
 		 583 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2063  hypothetical protein  23.48 
 
 		 153 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.21 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  21.71 
 
 		 482 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  25.7 
 
 		 948 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.19 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2230  hypothetical protein  32.95 
 
 		 356 aa  42.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323716 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1803  cyclic nucleotide-binding protein  24.6 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>