14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12587 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12587  predicted protein  100 
 
 
617 aa  1270    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.091239  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42002  predicted protein  64.23 
 
 
626 aa  832    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.707722  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23908  predicted protein  37.88 
 
 
639 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0896713  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47670  tocopherol cyclase  35.48 
 
 
622 aa  397  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25752  predicted protein  34.62 
 
 
650 aa  392  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00880  conserved hypothetical protein  34.29 
 
 
626 aa  348  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225651  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22145  predicted protein  33.88 
 
 
585 aa  347  3e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183468  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05450  multispanning membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13430)  29.71 
 
 
699 aa  307  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475774 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66462  predicted protein  34.09 
 
 
636 aa  305  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29586  predicted protein  29.33 
 
 
624 aa  280  6e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120128  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13662  predicted protein  29.53 
 
 
570 aa  268  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26299  predicted protein  34.21 
 
 
619 aa  243  6e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415226  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50995  predicted protein  25.37 
 
 
664 aa  187  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.680545 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47564  predicted protein  22.64 
 
 
682 aa  99.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>