More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_1241 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_1241  predicted protein  100 
 
 
520 aa  1075    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0309  DNA topoisomerase I  43.72 
 
 
1023 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130268  normal  0.23063 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  44.1 
 
 
872 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4953  DNA topoisomerase I  42.55 
 
 
946 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.47647  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1972  DNA topoisomerase I  43.12 
 
 
898 aa  378  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35810  DNA topoisomerase I  41.4 
 
 
921 aa  375  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.203227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  42.94 
 
 
877 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4305  DNA topoisomerase I  41.65 
 
 
1049 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  42.94 
 
 
877 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0497  DNA topoisomerase I  43.33 
 
 
919 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324618  normal  0.923376 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  40.81 
 
 
703 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  40.44 
 
 
703 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  42.62 
 
 
964 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  42.2 
 
 
874 aa  369  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4027  DNA topoisomerase I  41.88 
 
 
943 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.563129 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3355  DNA topoisomerase I  41.4 
 
 
911 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3149  DNA topoisomerase I  41.59 
 
 
912 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4408  DNA topoisomerase I  41.52 
 
 
949 aa  363  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0610462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3469  DNA topoisomerase I  41.44 
 
 
891 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.661677  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  40.93 
 
 
868 aa  363  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3876  DNA topoisomerase I  41.95 
 
 
968 aa  363  6e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26120  DNA topoisomerase I  40.43 
 
 
904 aa  360  3e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650116  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  42.88 
 
 
883 aa  360  4e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  41.21 
 
 
872 aa  359  5e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  39.7 
 
 
702 aa  359  7e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2705  DNA topoisomerase I  40.92 
 
 
878 aa  359  7e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0575  DNA topoisomerase I  41.67 
 
 
1031 aa  359  8e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  40.49 
 
 
693 aa  359  8e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  39.25 
 
 
691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  39.25 
 
 
691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1855  DNA topoisomerase I  41.06 
 
 
880 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000497797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0605  DNA topoisomerase I  39.96 
 
 
954 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2609  DNA topoisomerase I  41.06 
 
 
880 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0281339  decreased coverage  0.00102405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2489  DNA topoisomerase I  41.06 
 
 
880 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.297791  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1729  DNA topoisomerase I  41.21 
 
 
894 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0724746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2496  DNA topoisomerase I  41.06 
 
 
880 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  41.33 
 
 
868 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18080  DNA topoisomerase I  41.86 
 
 
944 aa  357  3.9999999999999996e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  40.67 
 
 
703 aa  356  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  40.26 
 
 
696 aa  356  5.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2250  DNA topoisomerase I  40.74 
 
 
880 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  39.14 
 
 
693 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  41.33 
 
 
868 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0738  DNA topoisomerase I  42.03 
 
 
978 aa  355  7.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9223  DNA topoisomerase  40.65 
 
 
883 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  40.95 
 
 
868 aa  355  7.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0378  DNA topoisomerase I  41.19 
 
 
905 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.381193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  40.22 
 
 
870 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2784  DNA topoisomerase I  41.79 
 
 
906 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  40.67 
 
 
869 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  40.67 
 
 
869 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  40.67 
 
 
869 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  40.15 
 
 
853 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  40.79 
 
 
691 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  40.67 
 
 
869 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1585  DNA topoisomerase I  41.03 
 
 
894 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.328544  normal  0.0409432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5396  DNA topoisomerase I  40.21 
 
 
955 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.585871  normal  0.0823046 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  41.03 
 
 
894 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4545  DNA topoisomerase I  40.07 
 
 
926 aa  353  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  40.22 
 
 
869 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  41.3 
 
 
825 aa  351  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04331  DNA topoisomerase I  40.47 
 
 
899 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0369496  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5182  DNA topoisomerase I  40.86 
 
 
957 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0291  DNA topoisomerase I  40.54 
 
 
923 aa  351  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  40.04 
 
 
876 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  40.37 
 
 
877 aa  351  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4796  DNA topoisomerase I  40.86 
 
 
957 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4882  DNA topoisomerase I  40.86 
 
 
957 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.010742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  41.03 
 
 
898 aa  350  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2328  DNA topoisomerase I  39.75 
 
 
895 aa  350  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.664503  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  40.33 
 
 
706 aa  350  4e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1276  topoisomerase I  39.07 
 
 
1028 aa  350  4e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1803  DNA topoisomerase I  40.07 
 
 
906 aa  350  4e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0789615  hitchhiker  0.0000387309 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04911  DNA topoisomerase I  41.32 
 
 
968 aa  349  5e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.624674 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  41.12 
 
 
692 aa  349  6e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0344  DNA topoisomerase I  40.6 
 
 
924 aa  349  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  41.12 
 
 
692 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  41.12 
 
 
692 aa  349  7e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  41.12 
 
 
692 aa  349  7e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  41 
 
 
839 aa  349  7e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  41.12 
 
 
692 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  41.12 
 
 
692 aa  349  7e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1535  DNA topoisomerase I  39.5 
 
 
896 aa  349  7e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1394  DNA topoisomerase I  40.68 
 
 
941 aa  348  9e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.590373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  40.76 
 
 
910 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  39.82 
 
 
813 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1768  DNA topoisomerase I  41.13 
 
 
968 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2197  DNA topoisomerase I  40.83 
 
 
923 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.777958  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2478  DNA topoisomerase I  40.15 
 
 
895 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  38.84 
 
 
690 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8444  DNA topoisomerase I  40.93 
 
 
944 aa  348  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0264145 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2841  DNA topoisomerase I  39.59 
 
 
889 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.598505  hitchhiker  0.00000400834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1924  DNA topoisomerase I  39.93 
 
 
868 aa  347  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  39.56 
 
 
767 aa  347  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  39.82 
 
 
879 aa  347  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25040  DNA topoisomerase I  39.58 
 
 
963 aa  346  5e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2193  DNA topoisomerase I  40.87 
 
 
883 aa  346  6e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  40.69 
 
 
711 aa  346  6e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  41.5 
 
 
692 aa  346  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1273  DNA topoisomerase  40.22 
 
 
948 aa  345  8e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.188892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>