More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12238 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_12238  predicted protein  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1352  50S ribosomal protein L4  44.19 
 
 		 208 aa  111  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1945  50S ribosomal protein L4  41.81 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  40.68 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  40.68 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2967  50S ribosomal protein L4  40.11 
 
 		 204 aa  99  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.191884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2817  50S ribosomal protein L4  40.35 
 
 		 208 aa  98.6  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  42.53 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  40.8 
 
 		 209 aa  97.1  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  38.86 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  37.64 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1365  50S ribosomal protein L4  41.01 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65413  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  38.33 
 
 		 221 aa  95.9  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1355  50S ribosomal protein L4  40.46 
 
 		 206 aa  95.5  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal  0.0533022 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  38.73 
 
 		 207 aa  94.4  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  37.85 
 
 		 206 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  41.57 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  40.34 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  38.12 
 
 		 207 aa  92.8  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  37.5 
 
 		 207 aa  92.8  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0579  50S ribosomal protein L4  40.45 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  42.94 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  38.64 
 
 		 211 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  38.64 
 
 		 211 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  40.56 
 
 		 206 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  40.45 
 
 		 206 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 207 aa  92  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  41.4 
 
 		 206 aa  91.7  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 207 aa  91.3  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  40.22 
 
 		 206 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  37.3 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0584  50S ribosomal protein L4  40.45 
 
 		 206 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0352  50S ribosomal protein L4  39.66 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3666  50S ribosomal protein L4  40.56 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  41.24 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  36.52 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  38.98 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5069  50S ribosomal protein L4  38.76 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.312873  normal  0.444752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  38.2 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  39.89 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  36.76 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  36.76 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  39.44 
 
 		 206 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  37.29 
 
 		 210 aa  88.2  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  37.29 
 
 		 206 aa  88.2  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  40.45 
 
 		 206 aa  87.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1957  50S ribosomal protein L4  37.64 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  38.98 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  37.64 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1195  50S ribosomal protein L4  37.64 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280242  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  39.04 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17340  Putative mitochondrial ribosomal protein L4  35.2 
 
 		 224 aa  85.1  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000952824  normal  0.0986734 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  37.5 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  39.77 
 
 		 207 aa  85.5  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  38.2 
 
 		 206 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  36.31 
 
 		 212 aa  84.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  36.22 
 
 		 206 aa  84.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  0.0000499421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  34.46 
 
 		 210 aa  84.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  39.66 
 
 		 208 aa  84.3  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  38.76 
 
 		 206 aa  84.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  39.89 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0611  50S ribosomal protein L4  35.03 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.937443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  35.39 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0267  ribosomal protein L4  37.85 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000000335514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  35.67 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  35.67 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  34.41 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  37.36 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  37.85 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  34.66 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  32.57 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0680  50S ribosomal protein L4  36.16 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0323983  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0370  50S ribosomal protein L4  34.09 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  35.96 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1615  50S ribosomal protein L4  37.99 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.140901 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  36.72 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0667  50S ribosomal protein L4  36.41 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764856  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0699  50S ribosomal protein L4  36.41 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231924  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0395  50S ribosomal protein L4  34.09 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0362  50S ribosomal protein L4  39.08 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1717  50S ribosomal protein L4  39.08 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  34.66 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  35.75 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0410  50S ribosomal protein L4  33.9 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2533  50S ribosomal protein L4  38.51 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  33.53 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  33.71 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0277  50S ribosomal protein L4  37.64 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  33.14 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  38.51 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>