More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12188 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_12188  predicted protein  100 
 
 
100 aa  199  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  37.37 
 
 
248 aa  87  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  38.38 
 
 
223 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  45.45 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  43.43 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  35 
 
 
286 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  36 
 
 
261 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  36 
 
 
261 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  43.43 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  37 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  37 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  35 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  45.92 
 
 
198 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  36 
 
 
247 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  45.92 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  35 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  36 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  35 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  45.92 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  35 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  43.88 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  37 
 
 
259 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  43.88 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  43.88 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  43.88 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  43.88 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  43.88 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  37 
 
 
259 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  43.88 
 
 
188 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  43.88 
 
 
188 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  38.83 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  32 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  39 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  40.82 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  37 
 
 
190 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  34 
 
 
225 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  39.6 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  37.37 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  38.38 
 
 
189 aa  67  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  33 
 
 
274 aa  67  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  35.35 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  39.6 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  33.67 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  33.33 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  33.33 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  33.67 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  33.67 
 
 
210 aa  64.3  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  34.65 
 
 
210 aa  64.3  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  38.24 
 
 
213 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
209 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  36 
 
 
208 aa  63.5  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  32.32 
 
 
206 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  32.32 
 
 
206 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  32.32 
 
 
206 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  38.61 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  32.32 
 
 
201 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  34.95 
 
 
205 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  32.32 
 
 
206 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  34.34 
 
 
204 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  37.11 
 
 
244 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  34.34 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  35.29 
 
 
186 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  36.36 
 
 
183 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  34 
 
 
195 aa  62.4  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  31.31 
 
 
206 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  32.38 
 
 
200 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  42.86 
 
 
178 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
200 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  33.33 
 
 
194 aa  61.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  31.31 
 
 
206 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  34.34 
 
 
178 aa  60.8  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  36.19 
 
 
204 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  35 
 
 
239 aa  59.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  32.32 
 
 
209 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  30.3 
 
 
203 aa  59.3  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  31.31 
 
 
203 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  33.65 
 
 
204 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  35.29 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  32.32 
 
 
204 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  30.39 
 
 
181 aa  58.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  35.79 
 
 
242 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  31.31 
 
 
195 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  36.27 
 
 
184 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  36.36 
 
 
201 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  31.31 
 
 
206 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  37.62 
 
 
199 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  37.25 
 
 
192 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  31.31 
 
 
195 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  35.64 
 
 
200 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  32.08 
 
 
204 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  35 
 
 
210 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3216  heat shock protein GrpE  35.92 
 
 
195 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116428  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.08 
 
 
207 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  29.29 
 
 
212 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  33.33 
 
 
240 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  31.68 
 
 
198 aa  57  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  34.31 
 
 
197 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  41.27 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>