209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12186 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_12186  coproporphyrinogen oxidase  100 
 
 
292 aa  610  9.999999999999999e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0767634  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4238  predicted protein  47.06 
 
 
319 aa  259  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432362  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64368  Oxygen-repressed protein  39.65 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03615  coproporphyrinogen III oxidase  40.61 
 
 
300 aa  219  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.94138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  40.86 
 
 
302 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  40.86 
 
 
302 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  39.78 
 
 
323 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  39.78 
 
 
302 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  39.78 
 
 
302 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  39.78 
 
 
302 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  38.01 
 
 
300 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  39.78 
 
 
302 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  39.78 
 
 
302 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30642  predicted protein  38.62 
 
 
368 aa  206  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00137682  normal  0.0422052 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15068  coproporphyrinogen III oxidase  40.21 
 
 
304 aa  206  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  39.43 
 
 
302 aa  205  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1970  coproporphyrinogen III oxidase  39.01 
 
 
308 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  38.65 
 
 
305 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  39.43 
 
 
306 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  38.75 
 
 
304 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1703  coproporphyrinogen III oxidase  39.24 
 
 
286 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586163  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  39.07 
 
 
310 aa  202  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  37.99 
 
 
304 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10640  coproporphyrinogen oxidase. coproporphyrinogen III oxidase. coproporphyrinogenase  41.1 
 
 
292 aa  202  7e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05130  coproporphyrinogen III oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07480)  37.3 
 
 
454 aa  202  8e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.44982  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  38.71 
 
 
305 aa  202  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  39.43 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  38.06 
 
 
307 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  42.29 
 
 
327 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  37.72 
 
 
312 aa  199  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  38.06 
 
 
304 aa  199  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1921  coproporphyrinogen III oxidase  40.5 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0674331  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  38.85 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0273  coproporphyrinogen III oxidase  40.5 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1674  coproporphyrinogen III oxidase  35.86 
 
 
342 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0469797  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1730  coproporphyrinogen III oxidase  37.94 
 
 
307 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.918171 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002066  coproporphyrinogen III oxidase aerobic  36.88 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0061  coproporphyrinogen III oxidase  38.97 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  38.75 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2014  coproporphyrinogen III oxidase  40.07 
 
 
302 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.396638  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17891  coproporphyrinogen III oxidase  36.18 
 
 
342 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1864  coproporphyrinogen III oxidase  40.07 
 
 
302 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  38.41 
 
 
304 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  39.07 
 
 
306 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  37.72 
 
 
310 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2077  coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 
310 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.727472  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1951  coproporphyrinogen III oxidase  36.68 
 
 
315 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  37.46 
 
 
345 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1949  coproporphyrinogen III oxidase  39.57 
 
 
302 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  38.01 
 
 
304 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  38.6 
 
 
307 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17731  coproporphyrinogen III oxidase  35.86 
 
 
342 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.932235  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  37.59 
 
 
305 aa  192  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 
299 aa  192  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  37.37 
 
 
307 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  38.41 
 
 
303 aa  192  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17691  coproporphyrinogen III oxidase  35.97 
 
 
342 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  38.06 
 
 
310 aa  192  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  37.02 
 
 
304 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  36.36 
 
 
347 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  37.85 
 
 
310 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  36.55 
 
 
309 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  37.85 
 
 
299 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1910  coproporphyrinogen III oxidase  39.64 
 
 
296 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  38.25 
 
 
307 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  38.87 
 
 
306 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  38.01 
 
 
323 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  38.87 
 
 
306 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  38.01 
 
 
323 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2263  coproporphyrinogen III oxidase  39.64 
 
 
296 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.792963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  37.02 
 
 
304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  36.36 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  37.67 
 
 
299 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 
299 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  36.64 
 
 
299 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 
299 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  38.06 
 
 
310 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00220  coproporphyrinogen III oxidase  38.41 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333342  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0017  coproporphyrinogen III oxidase  37.41 
 
 
323 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208175  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2320  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 
306 aa  189  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216124  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1339  coproporphyrinogen III oxidase  36.49 
 
 
306 aa  189  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  36.83 
 
 
346 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  36.83 
 
 
346 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  36.33 
 
 
307 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0243  coproporphyrinogen III oxidase  38.52 
 
 
336 aa  188  9e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571977  normal  0.975295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3201  coproporphyrinogen III oxidase  36.52 
 
 
323 aa  188  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.182007  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 
299 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  37.33 
 
 
299 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2294  Coproporphyrinogen oxidase  37.67 
 
 
304 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219751  hitchhiker  0.00200729 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00980  coproporphyrinogen oxidase, putative  37.29 
 
 
336 aa  188  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00531403  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  35.33 
 
 
375 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1900  coproporphyrinogen III oxidase  36.9 
 
 
334 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.646946  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4240  coproporphyrinogen III oxidase  37.94 
 
 
323 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  36.33 
 
 
299 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  37.67 
 
 
307 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  37.02 
 
 
304 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  36.33 
 
 
299 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  36.68 
 
 
299 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  36.33 
 
 
299 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  36.99 
 
 
299 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>