27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12144 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  34.55 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06902  60S acidic ribosomal protein P0, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13470)  35.34 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902791  normal  0.874223 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  36.49 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241207 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90212  predicted protein  31.74 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134219 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  24.1 
 
 		 334 aa  68.6  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  25.67 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  23.62 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  21.9 
 
 		 338 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  24.06 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  22.43 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  23.7 
 
 		 346 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  25 
 
 		 350 aa  51.6  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  19.37 
 
 		 346 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  29.35 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  20.94 
 
 		 284 aa  49.3  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  24.4 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  19.14 
 
 		 335 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  20.81 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  20.48 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  19.65 
 
 		 345 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  20.81 
 
 		 352 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  22.4 
 
 		 348 aa  45.1  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  20 
 
 		 336 aa  44.3  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  21.35 
 
 		 345 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  24.47 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  22.28 
 
 		 312 aa  42  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>