More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12028 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  100 
 
 
618 aa  1281    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  51.55 
 
 
516 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.19 
 
 
1831 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.89 
 
 
1652 aa  160  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  32.83 
 
 
1163 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  32.35 
 
 
1236 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.61 
 
 
1363 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.66 
 
 
740 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  35.66 
 
 
1714 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  30.47 
 
 
947 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  36.16 
 
 
696 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.56 
 
 
1196 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30.26 
 
 
1443 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06060  histone deacetylation-related protein, putative  26.33 
 
 
763 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  33.44 
 
 
1221 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.74 
 
 
1711 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  31.74 
 
 
1523 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  28.01 
 
 
1552 aa  133  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.94 
 
 
1510 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.99 
 
 
1760 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.7 
 
 
1557 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.26 
 
 
1686 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.49 
 
 
1789 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  28.83 
 
 
1858 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.8 
 
 
1474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.27 
 
 
1553 aa  128  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.76 
 
 
1481 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.25 
 
 
1193 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.13 
 
 
1247 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.02 
 
 
1599 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.85 
 
 
930 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.32 
 
 
1623 aa  124  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  29.58 
 
 
657 aa  124  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.69 
 
 
1364 aa  123  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  30.26 
 
 
1454 aa  123  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.45 
 
 
1240 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.32 
 
 
676 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  29.97 
 
 
344 aa  122  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  27.23 
 
 
1878 aa  122  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  29.02 
 
 
1807 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  28.21 
 
 
1766 aa  120  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  29.23 
 
 
317 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  31.89 
 
 
1190 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.7 
 
 
1901 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.15 
 
 
1188 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.25 
 
 
1607 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.32 
 
 
919 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.84 
 
 
1161 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.45 
 
 
1213 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.61 
 
 
677 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  30.82 
 
 
443 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.84 
 
 
1161 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.97 
 
 
692 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.5 
 
 
1188 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  31.38 
 
 
1217 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  30.96 
 
 
813 aa  117  5e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  28.74 
 
 
1176 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  32.49 
 
 
742 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.56 
 
 
833 aa  117  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  30.06 
 
 
1661 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  30.86 
 
 
335 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.87 
 
 
630 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  26.89 
 
 
1367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  28.74 
 
 
316 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  27.48 
 
 
1656 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.79 
 
 
1583 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  32.23 
 
 
335 aa  114  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  27.05 
 
 
464 aa  114  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  27.62 
 
 
1229 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.69 
 
 
1868 aa  113  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.1 
 
 
675 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.09 
 
 
1684 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  30.6 
 
 
1100 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.48 
 
 
1626 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.46 
 
 
1164 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  28.77 
 
 
344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.59 
 
 
1357 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.67 
 
 
1609 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  27.25 
 
 
518 aa  110  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.16 
 
 
1344 aa  110  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  29.31 
 
 
434 aa  110  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.35 
 
 
682 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  26.32 
 
 
782 aa  110  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.39 
 
 
1208 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.43 
 
 
924 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  27.59 
 
 
316 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.7 
 
 
576 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.93 
 
 
792 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  29 
 
 
1264 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  29 
 
 
1264 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.55 
 
 
733 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.22 
 
 
1411 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  30.2 
 
 
1348 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  29.86 
 
 
564 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  24.3 
 
 
1209 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  26.89 
 
 
316 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  28.37 
 
 
1416 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.12 
 
 
664 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  25.43 
 
 
1304 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  28.3 
 
 
346 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>