More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12004 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_12004  predicted protein  100 
 
 		 96 aa  193  8.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.984032  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02432  chaperonin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10700)  48.42 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  46.67 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86159  predicted protein  45.36 
 
 		 104 aa  91.3  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  46.15 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  46.15 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  46.15 
 
 		 105 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  47.73 
 
 		 98 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  46.15 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  47.19 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  46.15 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  43.96 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  48.35 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  46.15 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  41.76 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  45.05 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  43.96 
 
 		 98 aa  88.6  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  45.05 
 
 		 104 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  46.59 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  45.05 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  45.05 
 
 		 95 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  47.73 
 
 		 104 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  46.15 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  46.15 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  48.86 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  46.15 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  45.05 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  47.25 
 
 		 104 aa  87.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  46.15 
 
 		 96 aa  87.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  45.05 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  51.11 
 
 		 94 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  47.25 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  43.96 
 
 		 96 aa  87.4  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  43.96 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 96 aa  87.4  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  46.59 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  45.05 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 95 aa  86.7  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  42.86 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  45.56 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  43.96 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  43.96 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  48.35 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  44.32 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  45.45 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  42.22 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  42.86 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  43.18 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  44.32 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  44.32 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  42.86 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  47.73 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  43.96 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  47.25 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  47.25 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  43.96 
 
 		 104 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 105 aa  84.3  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  43.96 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  45.45 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  41.76 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  41.76 
 
 		 98 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  46.59 
 
 		 121 aa  84.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  40.43 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  42.05 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  46.59 
 
 		 95 aa  84  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  42.55 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  43.18 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  43.33 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  42.55 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  42.86 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  43.33 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  43.96 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  45.16 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  44.32 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  43.18 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  43.33 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  40.66 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2029  co-chaperonin GroES  41.76 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.218748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  41.11 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2615  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  43.96 
 
 		 96 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0645  co-chaperonin GroES  41.76 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0733336  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3452  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  43.96 
 
 		 96 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  41.11 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1568  co-chaperonin GroES  41.76 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  44.44 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  40.66 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0737  co-chaperonin GroES  41.76 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.060744  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5272  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3523  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  41.57 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3996  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0806135 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  47.73 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  40 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0136  co-chaperonin GroES  41.76 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0500096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  42.86 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>