288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11830 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_11830  predicted protein  100 
 
 		 161 aa  326  9e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13445  predicted protein  49.07 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_16545  predicted protein  49.36 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335884  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29913  predicted protein  42.33 
 
 		 217 aa  137  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10666  predicted protein  60 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34527  predicted protein  42.24 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.335485 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_8479  predicted protein  41.96 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013168  normal  0.105392 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65359  G4 quadruplex nucleic acid binding protein  39.86 
 
 		 381 aa  97.4  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01530  tRNA binding protein, putative  39.46 
 
 		 362 aa  95.9  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8112  predicted protein  53.66 
 
 		 88 aa  95.1  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.371613  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28697  predicted protein  37.75 
 
 		 232 aa  90.1  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.869582  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10474  cofactor for methionyl-and glutamyl-tRNA synthetases, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15940)  34.18 
 
 		 438 aa  87.4  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.134683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8313  predicted protein  36.88 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105668  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30537  predicted protein  32.87 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 642 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3541  hypothetical protein  41 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3256  hypothetical protein  41 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0626  hypothetical protein  41 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3368  hypothetical protein  41 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4388  hypothetical protein  41 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.83427  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02943  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0627  t-RNA-binding domain protein  40 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02893  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  39 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 686 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 663 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 645 aa  70.5  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 689 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 689 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1003  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 689 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 689 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 663 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 663 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 648 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 663 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 676 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 678 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 676 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 648 aa  68.2  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 689 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 676 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 676 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 650 aa  68.2  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 663 aa  67  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 644 aa  67  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 638 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 657 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 692 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 692 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 673 aa  65.1  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 675 aa  64.7  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 690 aa  64.3  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  34 
 
 		 672 aa  63.9  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 634 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 632 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03321  hypothetical protein  44.44 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 686 aa  63.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 678 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1596  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 700 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0255918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 678 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 654 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 		 650 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 673 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 642 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 664 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 793 aa  61.2  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 688 aa  60.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02927  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 661 aa  60.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 680 aa  60.8  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 691 aa  60.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 647 aa  60.8  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 731 aa  60.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 657 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 657 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 692 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1586  methionyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 733 aa  60.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 674 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 681 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 734 aa  59.7  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 670 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 678 aa  59.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  34 
 
 		 628 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 678 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 634 aa  59.7  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 654 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2758  methionyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 689 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  34 
 
 		 628 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  34 
 
 		 628 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 659 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 648 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3886  methionyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 682 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.444378 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1432  methionyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 700 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.111821  normal  0.539533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 710 aa  58.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 642 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 680 aa  58.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 675 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2484  methionyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 720 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.735844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 628 aa  57.8  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2993  methionyl-tRNA synthetase  31 
 
 		 708 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.953372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>