159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11743 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_11743  predicted protein  100 
 
 
264 aa  548  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.555211  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1934  hypothetical protein  35.34 
 
 
257 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000499143  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2547  hypothetical protein  37.02 
 
 
259 aa  152  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0482  hypothetical protein  33.59 
 
 
258 aa  149  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.520329  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1979  hypothetical protein  35.36 
 
 
260 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112222  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1188  hypothetical protein  35.47 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.854  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3037  hypothetical protein  37.22 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196255  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1375  hypothetical protein  35.36 
 
 
260 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.508327  hitchhiker  0.00492897 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0363  hypothetical protein  33.98 
 
 
252 aa  146  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000177188  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1467  hypothetical protein  34.85 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000638991  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1161  hypothetical protein  34.85 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000956326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0708  hypothetical protein  34.85 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1330  hypothetical protein  34.85 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0444  hypothetical protein  34.85 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1321  hypothetical protein  34.85 
 
 
260 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.522581  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5551  hypothetical protein  34.98 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0575  protein of unknown function DUF328  34.96 
 
 
257 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3824  hypothetical protein  34.23 
 
 
256 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3600  hypothetical protein  33.72 
 
 
258 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0805  hypothetical protein  33.72 
 
 
258 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.224825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3473  hypothetical protein  33.72 
 
 
258 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.957254  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1090  hypothetical protein  35.23 
 
 
260 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004446  hypothetical protein  35.09 
 
 
258 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00375515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00949  hypothetical protein  34.91 
 
 
289 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3046  hypothetical protein  34.73 
 
 
262 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2009  hypothetical protein  36.4 
 
 
257 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0686  hypothetical protein  34.34 
 
 
257 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063127  normal  0.0520142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2893  hypothetical protein  32.82 
 
 
257 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3860  hypothetical protein  34.34 
 
 
257 aa  142  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0753  hypothetical protein  36.09 
 
 
258 aa  142  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1611  hypothetical protein  34.6 
 
 
260 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2223  hypothetical protein  34.6 
 
 
260 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1054  hypothetical protein  34.6 
 
 
260 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00231161  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2247  hypothetical protein  34.6 
 
 
260 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03318  hypothetical protein  34.62 
 
 
259 aa  142  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1650  hypothetical protein  33.72 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3180  hypothetical protein  34.22 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0791396  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3665  hypothetical protein  34.59 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1068  hypothetical protein  34.1 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.786925  normal  0.0318222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2092  hypothetical protein  31.82 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.786423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0005  hypothetical protein  31.94 
 
 
257 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0005  hypothetical protein  31.94 
 
 
257 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0005  hypothetical protein  31.94 
 
 
257 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0005  hypothetical protein  31.94 
 
 
257 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0637  hypothetical protein  36.09 
 
 
270 aa  139  7e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000248994  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2372  hypothetical protein  33.46 
 
 
259 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0542  hypothetical protein  32.84 
 
 
266 aa  138  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1840  hypothetical protein  36.98 
 
 
257 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360763  normal  0.0166065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0005  hypothetical protein  31.94 
 
 
257 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0915517  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0568  hypothetical protein  32.83 
 
 
257 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.255606  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00006  hypothetical protein  33.21 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0007  hypothetical protein  33.21 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132956  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3649  hypothetical protein  33.21 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08011  hypothetical protein  36 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00006  hypothetical protein  33.21 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0007  hypothetical protein  33.21 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.865833  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2164  hypothetical protein  36.6 
 
 
257 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0514757  normal  0.0821317 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2140  hypothetical protein  34.6 
 
 
260 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540337  normal  0.546865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0005  hypothetical protein  33.21 
 
 
258 aa  135  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0536  protein of unknown function DUF328  34.33 
 
 
260 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1317  hypothetical protein  33.72 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2261  hypothetical protein  34.22 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3166  hypothetical protein  33.72 
 
 
258 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.819835  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0554  hypothetical protein  33.33 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1032  hypothetical protein  33.21 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0006  hypothetical protein  32.18 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0006  hypothetical protein  32.83 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1078  hypothetical protein  34.02 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0961  hypothetical protein  34.98 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1172  hypothetical protein  31.94 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662366  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4480  hypothetical protein  33.85 
 
 
255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487032  normal  0.526273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2161  hypothetical protein  34.09 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1014  hypothetical protein  35.19 
 
 
261 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11220  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.92361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4905  hypothetical protein  33.85 
 
 
252 aa  132  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4565  hypothetical protein  33.59 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.522206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3590  protein of unknown function DUF328  31.8 
 
 
258 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1320  hypothetical protein  32.82 
 
 
254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3713  hypothetical protein  32.06 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0291165  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2407  hypothetical protein  30.8 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3333  hypothetical protein  32.2 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1244  hypothetical protein  32.95 
 
 
259 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1284  hypothetical protein  32.44 
 
 
256 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00673755  normal  0.205334 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2896  hypothetical protein  33.71 
 
 
258 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.423093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0239  hypothetical protein  34.38 
 
 
251 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000011533  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2644  hypothetical protein  32.31 
 
 
262 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3597  hypothetical protein  32.81 
 
 
260 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3620  hypothetical protein  30.42 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.558982  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2119  hypothetical protein  31.18 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1607  hypothetical protein  32.05 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5283  hypothetical protein  32.21 
 
 
261 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0804357  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1064  hypothetical protein  32.83 
 
 
259 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0978  hypothetical protein  33.46 
 
 
261 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1048  hypothetical protein  32.21 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000331032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1115  hypothetical protein  32.58 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210932  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3241  hypothetical protein  32.21 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3291  hypothetical protein  31.92 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1289  hypothetical protein  32.43 
 
 
259 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.657969  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0917  hypothetical protein  33.59 
 
 
257 aa  125  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000728538  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1149  hypothetical protein  32.21 
 
 
257 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.536283 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>