192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11563 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  100 
 
 
238 aa  474  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  41.38 
 
 
241 aa  186  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10848  predicted protein  41 
 
 
261 aa  181  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5235  predicted protein  36.73 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540131  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82287  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit)  35.06 
 
 
441 aa  119  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.770378 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  31.5 
 
 
412 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  32.42 
 
 
482 aa  113  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  32.69 
 
 
528 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12655  predicted protein  25.69 
 
 
260 aa  85.5  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.46 
 
 
503 aa  75.1  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2593  cyclic nucleotide-binding protein  23.88 
 
 
707 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25 
 
 
858 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  37.36 
 
 
512 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  36.04 
 
 
308 aa  61.6  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  29.01 
 
 
148 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  24.44 
 
 
811 aa  58.9  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0285  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
149 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0380  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.21 
 
 
148 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0178  cyclic nucleotide-binding protein  34.86 
 
 
138 aa  58.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220978  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  33.03 
 
 
449 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40 
 
 
171 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  29.77 
 
 
151 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  25.56 
 
 
868 aa  56.6  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  30.36 
 
 
265 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0441  cyclic nucleotide-binding  30.36 
 
 
148 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
151 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0279  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.95 
 
 
149 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.16 
 
 
597 aa  55.5  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0496  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  43.33 
 
 
129 aa  55.5  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
149 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0590  cyclic nucleotide-binding protein  22.47 
 
 
801 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120802  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.38 
 
 
151 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  34.38 
 
 
417 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4561  predicted protein  33.33 
 
 
121 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27248  predicted protein  29.05 
 
 
680 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.2735 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29662  predicted protein  29.05 
 
 
680 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226582  normal  0.0425728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  33.33 
 
 
1048 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 
948 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  27.88 
 
 
454 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.73 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.71 
 
 
226 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  31.36 
 
 
495 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.63 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  28.28 
 
 
160 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  29.82 
 
 
265 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  32.08 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  28.18 
 
 
583 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  28.21 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  24.29 
 
 
149 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  27.45 
 
 
161 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.13 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  29.09 
 
 
628 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  24.29 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2270  cyclic nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
477 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  29.85 
 
 
147 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  27.71 
 
 
482 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  36.71 
 
 
507 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  31.58 
 
 
355 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.36 
 
 
408 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.67 
 
 
1075 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  22.17 
 
 
1177 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  43.9 
 
 
388 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  27.93 
 
 
322 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  29.84 
 
 
153 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0718  cyclic nucleotide-binding  23.62 
 
 
747 aa  49.7  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00567448  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 
637 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.11 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  20.75 
 
 
482 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  32.93 
 
 
367 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
226 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  24.76 
 
 
1124 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  29.03 
 
 
153 aa  49.3  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  28.24 
 
 
425 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  32.43 
 
 
151 aa  48.9  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.24 
 
 
425 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
254 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.45 
 
 
505 aa  48.5  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0840  cyclic nucleotide-binding protein  27.96 
 
 
350 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 
222 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  23.47 
 
 
1171 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.5 
 
 
220 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.13 
 
 
231 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  28.3 
 
 
1040 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  31.87 
 
 
749 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  24.11 
 
 
147 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.69 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  27.45 
 
 
435 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  29.36 
 
 
151 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  30.3 
 
 
154 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1472  CAAX amino terminal protease family  31.25 
 
 
381 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.407531  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
167 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 
489 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
232 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10105  hypothetical protein  28.57 
 
 
504 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  31.46 
 
 
624 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4796  cyclic nucleotide-binding (cNMP-bd) protein  30.59 
 
 
263 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370555  unclonable  0.0000216721 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.3 
 
 
223 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  25.25 
 
 
230 aa  47  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
225 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>