17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11390 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11390  predicted protein  100 
 
 
400 aa  833    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12884  predicted protein  49.16 
 
 
417 aa  372  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46154  predicted protein  42.22 
 
 
427 aa  301  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938893  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_2215  predicted protein  40.66 
 
 
415 aa  299  7e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17319  predicted protein  40.55 
 
 
455 aa  280  3e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  normal  0.072463 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43116  predicted protein  38.41 
 
 
726 aa  199  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00100373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2581  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
421 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170764  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3925  group 1 glycosyl transferase  24.18 
 
 
421 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 
461 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
386 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0304  glycosyl transferase  30.84 
 
 
372 aa  47.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0175476  unclonable  0.000000745959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25140  glycosyltransferase  24.7 
 
 
405 aa  47.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 
476 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
536 aa  43.1  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>