14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11337 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11337  predicted protein  100 
 
 		 319 aa  654    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86424  Translational repressor Pumilio/PUF3 and related RNA-binding proteins (Puf superfamily)  40.62 
 
 		 835 aa  238  8e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06587  mRNA binding protein Pumilio 2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04310)  42.76 
 
 		 849 aa  223  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0209854  normal  0.827915 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04870  hypothetical protein  37.15 
 
 		 673 aa  218  8.999999999999998e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04280  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 948 aa  186  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.429962  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10071  RNA-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02510)  31.41 
 
 		 650 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.873543 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2772  predicted protein  31.68 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0544491  normal  0.134886 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66941  predicted protein  31.07 
 
 		 794 aa  147  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.979611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80937  protein necessary for high temperature growth  27.95 
 
 		 528 aa  116  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04285  Pumilio-family RNA binding repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G04340)  29.03 
 
 		 802 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.428204 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9143  predicted protein  29 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44147  predicted protein  23.75 
 
 		 714 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07474  RNA binding protein Jsn1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05610)  23.36 
 
 		 1175 aa  62.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.54562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_77995  predicted protein  25.49 
 
 		 1127 aa  43.5  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>