236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11308 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11308  predicted protein  100 
 
 
89 aa  179  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06256  peptidyl prolyl cis-trans isomerase Cyclophilin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12990)  44.71 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218762  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  41.77 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  43.04 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  41.77 
 
 
94 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  41.77 
 
 
94 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  39.24 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  39.24 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  39.24 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  38.27 
 
 
92 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  40.51 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  37.5 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  44.87 
 
 
89 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  38.96 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  36.71 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
90 aa  60.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  42.11 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  37.97 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 
222 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  34.18 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
149 aa  59.3  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  32.53 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  36.84 
 
 
245 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  38.16 
 
 
250 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  38.16 
 
 
250 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  32.93 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  40.51 
 
 
90 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
105 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3438  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
125 aa  58.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0963576  normal  0.0234751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  40.51 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  36.84 
 
 
222 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1274  glycine-rich RNA-binding protein  31.76 
 
 
112 aa  57.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000000837257  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  36.84 
 
 
202 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  36.71 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  41.77 
 
 
162 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 
203 aa  57  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  43.42 
 
 
88 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  36.71 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  32.89 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  38.16 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  36.25 
 
 
207 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  38.67 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  31.17 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  34.21 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0565  RNA-binding region RNP-1  43.04 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  31.17 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1332  RNA-binding protein  31.71 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.534120000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  39.24 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  36.25 
 
 
441 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  34.21 
 
 
217 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  42.11 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  34.21 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  30 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 
173 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  28.57 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0338  RNA-binding protein  41.03 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  39.74 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  36.84 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  32.91 
 
 
90 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  35.44 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  36.71 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
89 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  36.84 
 
 
196 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_13471  RNA-binding protein  37.1 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0775963 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  34.94 
 
 
117 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  41.33 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3309  RNP-1 like RNA-binding protein  35.8 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000788689  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 
85 aa  52.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  34.18 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  32.93 
 
 
632 aa  52  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  40 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  35.53 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  40.79 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  40.79 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>