More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_1129 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_1129  predicted protein  100 
 
 
562 aa  1164    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  39.05 
 
 
700 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  42.93 
 
 
798 aa  389  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  41.9 
 
 
668 aa  377  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  38.83 
 
 
537 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 
537 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  39.82 
 
 
548 aa  331  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  39.38 
 
 
539 aa  327  4.0000000000000003e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  39.82 
 
 
531 aa  325  9e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  38.11 
 
 
602 aa  322  8e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.83 
 
 
532 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  37.5 
 
 
545 aa  317  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
546 aa  302  9e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.51 
 
 
640 aa  294  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 
542 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 
552 aa  266  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  33.16 
 
 
516 aa  259  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
525 aa  257  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 
543 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
518 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.69 
 
 
530 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.41 
 
 
591 aa  245  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
519 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.61 
 
 
525 aa  243  5e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 
532 aa  243  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 
532 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 
566 aa  239  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 
600 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 
528 aa  237  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 
574 aa  236  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.36 
 
 
583 aa  233  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 
519 aa  232  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
568 aa  231  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  32.5 
 
 
517 aa  229  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 
529 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 
519 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
536 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 
639 aa  227  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  31.92 
 
 
603 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
582 aa  227  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 
533 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 
603 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.21 
 
 
605 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
579 aa  220  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.83 
 
 
554 aa  220  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
573 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
583 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 
572 aa  219  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 
595 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.52 
 
 
585 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 
567 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 
574 aa  216  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
575 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 
582 aa  216  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 
577 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 
582 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
573 aa  213  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.88 
 
 
567 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  28.44 
 
 
520 aa  211  3e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
582 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  32.57 
 
 
579 aa  211  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
578 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
534 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
593 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
555 aa  204  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
562 aa  204  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 
543 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
522 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
546 aa  199  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 
524 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
579 aa  197  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  30.08 
 
 
525 aa  196  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 
552 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 
543 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  30.65 
 
 
559 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 
560 aa  193  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
540 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 
559 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.63 
 
 
587 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 
576 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
569 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
556 aa  186  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.56 
 
 
529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
584 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
582 aa  180  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 
567 aa  180  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 
545 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 
520 aa  177  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
581 aa  176  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
554 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.9 
 
 
557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.37 
 
 
573 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.37 
 
 
557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 
576 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 
557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
579 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 
579 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
559 aa  173  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
579 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>