More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11236 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11236  predicted protein  100 
 
 
500 aa  1008    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  39.47 
 
 
457 aa  338  9e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  40.41 
 
 
476 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  38.16 
 
 
454 aa  336  5e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  41.09 
 
 
465 aa  336  5.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  41.72 
 
 
449 aa  336  7e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  37.78 
 
 
453 aa  334  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  39.31 
 
 
454 aa  332  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  41.19 
 
 
448 aa  330  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  38.85 
 
 
453 aa  330  4e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  39.8 
 
 
454 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  39.06 
 
 
457 aa  329  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  42.63 
 
 
460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  39.14 
 
 
457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  40.16 
 
 
458 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  40.37 
 
 
484 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  39.88 
 
 
458 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  38.24 
 
 
455 aa  326  5e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  42.94 
 
 
464 aa  325  8.000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  37.78 
 
 
453 aa  325  9e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  41.1 
 
 
460 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  40.37 
 
 
449 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  43.09 
 
 
462 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  37.53 
 
 
458 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  37.22 
 
 
459 aa  324  2e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  40.89 
 
 
464 aa  323  4e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  40.04 
 
 
462 aa  323  5e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  39.63 
 
 
458 aa  323  6e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  39.75 
 
 
458 aa  323  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  39.63 
 
 
458 aa  323  6e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  39.63 
 
 
458 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  39.63 
 
 
458 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  39.63 
 
 
458 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  39.63 
 
 
458 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  39.22 
 
 
458 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  39.59 
 
 
453 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  39.8 
 
 
461 aa  320  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  43.56 
 
 
415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  39.63 
 
 
462 aa  320  6e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  38.73 
 
 
458 aa  319  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  44.44 
 
 
408 aa  319  7.999999999999999e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  40.57 
 
 
450 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  39.18 
 
 
453 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  39.14 
 
 
451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  39.07 
 
 
453 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  38.07 
 
 
463 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  42.48 
 
 
462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  38.59 
 
 
452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  40 
 
 
453 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  37.01 
 
 
457 aa  312  7.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  38.7 
 
 
457 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1732  DNA repair protein RadA  43.16 
 
 
462 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0794111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  39.67 
 
 
449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  38.9 
 
 
454 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  38.9 
 
 
454 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  38.32 
 
 
470 aa  309  9e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  36.44 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  42.07 
 
 
462 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  40.25 
 
 
450 aa  306  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  38.52 
 
 
452 aa  306  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  39.63 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  35.66 
 
 
457 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  38.98 
 
 
457 aa  304  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  39.8 
 
 
455 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  39.06 
 
 
463 aa  303  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0994  DNA repair protein RadA  37.91 
 
 
457 aa  302  9e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1179  DNA repair protein RadA  37.76 
 
 
457 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.595072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  39.6 
 
 
455 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  36.29 
 
 
514 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  36.29 
 
 
514 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3182  DNA repair protein RadA  40.4 
 
 
465 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.540345 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  36.59 
 
 
461 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2606  DNA repair protein RadA  35.64 
 
 
460 aa  297  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  40.28 
 
 
471 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  36.84 
 
 
459 aa  296  4e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  36.2 
 
 
447 aa  296  6e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  39.14 
 
 
448 aa  296  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  38.16 
 
 
482 aa  296  7e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4644  DNA repair protein RadA  39.39 
 
 
456 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.592741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4506  DNA repair protein RadA  39.39 
 
 
456 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4638  DNA repair protein RadA  39.39 
 
 
456 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.854791  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  36.61 
 
 
461 aa  295  1e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  39.88 
 
 
467 aa  294  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  38.99 
 
 
455 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  37.68 
 
 
481 aa  292  8e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  35.99 
 
 
446 aa  292  9e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  34.76 
 
 
446 aa  292  9e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  35.86 
 
 
518 aa  292  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  37.5 
 
 
482 aa  291  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  38.99 
 
 
477 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  36.29 
 
 
459 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  37.8 
 
 
489 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  38.26 
 
 
453 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  35.64 
 
 
446 aa  289  6e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  35.66 
 
 
507 aa  289  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  39.14 
 
 
466 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  37.98 
 
 
453 aa  289  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  39.31 
 
 
476 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01540  DNA repair protein RadA  38.57 
 
 
464 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.850923  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  35.83 
 
 
459 aa  288  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>